La biotechnologie est une industrie caractérisée par des hauts et des bas.

Nous traversons actuellement une phase de croissance passionnante en raison de l'essor rapide de l'intelligence artificielle (IA) et de ses applications potentielles. L'intersection de l'IA et de la biotechnologie est très prometteuse, car elle offre des opportunités de réaliser d'importantes avancées biologiques. Cette croissance a modifié le paysage du financement par capital-risque de manière nouvelle et passionnante et a présenté de nouveaux défis pour les startups du secteur de la biotechnologie.

Dans cet article de blog, nous explorerons l'état actuel du financement par capital-risque (VC) dans le secteur de la biotechnologie, la meilleure façon de vous y retrouver et l'avenir de la biotechnologie.

Les promesses de l'IA dans le domaine de la biotechnologie et ses répercussions sur les sociétés de capital-risque

La capacité de l'IA à traiter de grandes quantités de données et à identifier des modèles a ouvert de nouvelles voies pour l'innovation en biotechnologie. Avec le intégration de l'IA prédictive et générative, les chercheurs peuvent rationaliser les processus de découverte de médicaments, identifier des cibles potentielles et accélérer les essais cliniques.

L'optimisme croissant quant à la capacité de l'IA à révolutionner le domaine a attiré l'attention des investisseurs qui cherchent à tirer parti de cette technologie transformatrice.

Alors que le financement de démarrage dans les entreprises de biotechnologie est resté relativement stable, il y a eu une baisse du financement de série A et des financements en phase de démarrage. Cette évolution suggère une approche plus prudente de la part des investisseurs dans les sociétés de financement au fur et à mesure que celles-ci progressent dans leur phase de développement.

Ce que veulent les investisseurs

Les investisseurs recherchent des entreprises capables d'atteindre des objectifs importants avec un minimum de ressources, en promouvant une approche rationalisée et rentable des opérations. Par conséquent, les start-up biotechnologiques doivent adopter des stratégies donnant la priorité à une allocation efficace des ressources tout en poursuivant des innovations révolutionnaires.

De plus, la communauté des investisseurs est devenue plus réticente au risque. Les investisseurs manifestent une préférence pour les entreprises qui concilient ambition et stratégie de gestion des risques solide. Cette évolution souligne la nécessité pour les startups de démontrer une compréhension claire de leur marché, des défis à relever et des obstacles réglementaires potentiels pour gagner la confiance des investisseurs.

Défis et solutions pour les entreprises en démarrage

En raison de ces changements de comportement en matière d'investissement, les entreprises de biotechnologie en phase de démarrage doivent se concentrer sur l'efficacité du capital et démontrer rapidement une proposition de valeur unique pour garantir un financement à court et à long terme.

Mais comment ? La plupart des jeunes entreprises de biotechnologie ont besoin d'investissements importants en R&D pour générer des données prometteuses, et les dépenses excessives peuvent grever les ressources d'une entreprise, entravant ainsi sa croissance. Par conséquent, la gestion de la liquidité et la réduction de la volatilité sont des facteurs essentiels si une start-up souhaite exister dans un an.

Voici trois conseils pour gérer efficacement votre argent et vos risques.

Conseil #1 : Diversifier les sources de financement

L'implication de divers investisseurs est cruciale pour la croissance et la stabilité du secteur des biotechnologies. Alors que de nouveaux fonds biotechnologiques sont souvent annoncés, le secteur assiste à une injection de capitaux provenant de différentes sources.

Cette diversité élargit le bassin de financement disponible et apporte un éventail d'expertise et de points de vue. Pour garantir un financement continu, les startups doivent rechercher activement des opportunités d'investissement qui correspondent à leurs objectifs à long terme et nouer des partenariats stratégiques afin de maximiser leurs chances de succès.

Conseil #2 : Explorez les avantages fiscaux et restez au fait de l'évolution des exigences réglementaires

Les startups devraient explorer les Avantages fiscaux des actions qualifiées pour petites entreprises (QSBS), car ces incitations peuvent apporter des avantages importants en matière de collecte de fonds et de gestion du capital. Il s'agit notamment des économies d'impôts, des programmes d'incitation pour les employés, de la flexibilité financière, etc.

En outre, le fait de rester informées des modifications réglementaires et des incitations dans le secteur des biotechnologies peut aider les entreprises à tirer parti des conditions favorables et à surmonter les défis potentiels. Par exemple, les thérapies cellulaires et géniques ont un potentiel important pour révolutionner la médecine. Cependant, le développement et la production de ces produits nécessitent de nouvelles technologies, et les agences de réglementation doivent évaluer et fournir des conseils clairs à l'énorme groupe d'entreprises qui cherchent à traduire leurs candidats précliniques en clinique.

Conseil #3 : Solutions évolutives grâce à l'IA

Les problèmes biotechnologiques devenant de plus en plus complexes, la demande de solutions technologiques sophistiquées augmente. Heureusement, les progrès de l'IA et des technologies connexes offrent de nouvelles solutions et de nouvelles perspectives. Dans les sciences de la vie, l'IA est largement applicable, de l'agriculture à la médecine. L'évolutivité et l'adaptabilité inhérentes à ces solutions peuvent aider à relever la complexité croissante des défis biologiques, ce qui permettra de réaliser des avancées importantes dans un avenir proche. L'IA peut aider les startups à réduire les risques et à être plus rentables en raccourcissant le chemin entre les données et les informations.

L'avenir est prometteur

L'anticipation d'une annonce d'une baisse des taux d'intérêt en 2024 annonce une année de croissance potentielle pour l'industrie biotechnologique et un avenir prometteur qui pourrait favoriser l'innovation et accroître les investissements. Les entreprises doivent toutefois rester agiles et s'adapter à l'évolution des conditions du marché tout en étant soucieuses de leur durabilité à long terme.

Les biotechnologies se situent actuellement à l'intersection des avancées technologiques et des opportunités d'investissement. Compte tenu de l'importance croissante de l'IA et de sa capacité à catalyser des avancées, ce domaine est très prometteur. Le secteur de la biotechnologie traverse une phase de transformation, alimentée par les progrès de l'IA et les possibilités d'innovation. Les jeunes entreprises de biotechnologie peuvent se positionner pour réussir en naviguant efficacement dans le paysage du financement, en gérant les risques et en adoptant des solutions technologiques.

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Dans le domaine des sciences de la vie, les plasmides, molécules d'ADN bicaténaires autosuffisantes, sont des outils inestimables largement utilisés dans les laboratoires pour le génie génétique, la synthèse de protéines recombinantes, le développement de vaccins et de thérapies et l'analyse de la fonction génique. En raison de leur capacité à transporter des gènes spécifiques et à réguler leur expression, les plasmides jouent un rôle crucial dans le développement de thérapies géniques et de vaccins, offrant un contrôle et une sélectivité inégalés.

Cependant, la gestion d'une bibliothèque de plasmides en pleine expansion peut être difficile, étant donné que des changements infimes dans leur séquence peuvent survenir pendant le clonage, le passage ou l'optimisation pour une expression et une efficacité accrues. De plus, leur qualité peut se dégrader au fil du temps en raison d'un stockage inapproprié ou d'une contamination. La clé pour surmonter ces complexités réside dans des protocoles de conservation et de stockage rigoureux impliquant des identifiants uniques, des contrôles de qualité fréquents et l'utilisation de bases de données numériques telles que des trackers Microsoft Excel, un système de gestion des informations de laboratoire (LIMS) dédié ou Carnets de laboratoire électroniques (ELN). Il est essentiel de faire preuve d'une extrême prudence lors de l'utilisation de ces systèmes, car toute inexactitude dans le squelette plasmidique, la résistance aux antibiotiques, le marqueur de sélection ou les cellules bactériennes optimales à transformer peut créer de la confusion, des erreurs et une perte inutile de temps et de ressources.

Dans ce blog, nous présenterons certains des plasmides couramment utilisés dans le domaine des sciences de la vie et fournirons quelques bonnes pratiques pour créer, maintenir, gérer et stocker une bibliothèque de plasmides.

Les plasmides les plus utilisés en R&D

Tout comme le choix du bon outil pour un travail, il est essentiel de créer une bibliothèque de plasmides adaptée à vos besoins de recherche. Les chercheurs disposent généralement d'une variété de plasmides de base et de leurs dérivés dans leur répertoire, prêts à être utilisés en fonction du type d'expérience prévu. Par exemple, pour comprendre le rôle d'un gène dans un modèle de maladie, vous pouvez créer une bibliothèque de plasmides composée de divers domaines fonctionnels du gène ou de variants dépourvus de domaines spécifiques et porteurs de mutations ciblées. Le maintien d'informations organisées sur chaque plasmide, y compris le squelette, la stratégie de clonage et la stratégie de purification, est crucial pour obtenir des résultats fiables et reproductibles.

De nombreux variants plasmidiques sont largement utilisés dans la recherche et le développement, les plus populaires étant les vecteurs pUC19, les vecteurs pET, les vecteurs pGEX, les vecteurs pBABE et les vecteurs lentiviraux. Les vecteurs pUC19 ont joué un rôle central dans le séquençage de l'ADN, la production de protéines recombinantes, le génie génétique des cultures et les études de génétique bactérienne. Les vecteurs pET, connus pour leur expression protéique élevée dans E. coli, sont réputés pour leur promoteur T7, leurs marqueurs de sélection et leurs multiples sites de clonage, balises de fusion et expression inductible. Les vecteurs pGEx, en revanche, sont utilisés pour exprimer et purifier des protéines recombinantes fusionnées à la glutathion S-transférase (GST) dans E. coli. Les vecteurs pBABE permettent le transfert de gènes rétroviraux et une expression génique stable dans les cellules de mammifères. Enfin, les vecteurs lentiviraux sont préférés pour le transfert de gènes et la thérapie génique dans les cellules de mammifères, car ils permettent une administration génique efficace, l'édition de gènes et des utilisations potentielles dans le traitement du cancer et le développement de vaccins.

Techniques de biologie moléculaire pour travailler avec des plasmides

Une pléthore de techniques de biologie moléculaire sont utilisées dans les laboratoires humides pour la création et la maintenance de bibliothèques de plasmides, chacune étant adaptée aux exigences spécifiques du projet. Certaines techniques couramment utilisées incluent Amplification par PCR, la digestion par les enzymes de restriction et la ligature, qui contribuent à l'amplification, à l'isolement et à l'insertion de gènes ou de fragments de gènes dans les plasmides. La transformation est une procédure fondamentale impliquant l'introduction de plasmides dans des cellules bactériennes à des fins de réplication et de maintenance.

Après la transformation, la sélection basée sur les antibiotiques ou la fluorescence joue un rôle crucial dans le maintien des cellules avec des plasmides. Le séquençage aide à déterminer la séquence d'ADN des plasmides ou des bibliothèques, facilitant ainsi l'identification de gènes ou de fragments d'ADN spécifiques. L'extraction et la purification de l'ADN, qui comprennent des processus tels que la lyse alcaline, la précipitation et la purification sur colonne ou sur billes, sont nécessaires pour isoler l'ADN des cellules bactériennes. Des techniques de clonage innovantes telles que Assemblage Gibson ou assemblage Golden Gate peut également être utilisé pour la synthèse de plasmides. Le choix des techniques les plus appropriées pour la construction et la maintenance de bibliothèques de plasmides dépend de plusieurs facteurs spécifiques au projet, tels que la taille de la bibliothèque, le type de plasmides utilisé et les applications en aval prévues.

Il est temps de faire passer votre bibliothèque de plasmides au niveau supérieur

La création, la gestion et l'analyse d'une bibliothèque de plasmides peuvent être complexes, mais avec les bons outils et les bonnes stratégies, vous pouvez créer une ressource durable qui fera avancer vos recherches. Il est essentiel de savoir comment maintenir, stocker et gérer efficacement votre bibliothèque de plasmides pour garantir des résultats cohérents et fiables dans votre travail.

Heureusement, nous avons élaboré un guide détaillé intitulé « Le guide ultime pour créer, gérer et analyser votre bibliothèque de plasmides ». Ce guide fournit des informations complètes sur les points suivants :

• Création d'une bibliothèque de plasmides durable
• Meilleures pratiques pour la gestion d'une bibliothèque de plasmides
• Meilleures pratiques pour le stockage de votre bibliothèque de plasmides
• Utilisation d'outils logiciels pour la bibliothèque de plasmides in silico et la gestion des séquences

En utilisant ce guide, vous pouvez optimiser vos stratégies, rationaliser vos processus et maintenir vos recherches à la pointe des découvertes scientifiques.

Dans la recherche, comme dans la vie, il y a des revers, des tragédies et des mésaventures.

Des problèmes électriques imprévus, une intervention humaine accidentelle ou intentionnelle ou des conditions météorologiques extrêmes peuvent tous avoir des conséquences durables sur les échantillons, l'inventaire, les données, les dossiers de votre laboratoire et, en fin de compte, sur le rythme auquel vous vous rétablissez et progressez dans vos recherches.

Prenons, par exemple, un histoire récente de l'Institut polytechnique de Rensselaer (RPI), où un gardien, agacé par une alarme provenant d'un congélateur à très basse température (ULT), aurait actionné un disjoncteur, faisant chauffer le congélateur à -32 ℃ par rapport à sa température normale de -80 ℃.

Les conséquences ont été dévastatrices : la destruction d'échantillons prélevés au cours de 25 années de recherche et des dommages d'au moins 1 million de dollars.

Au cours des deux dernières décennies, des phénomènes météorologiques extrêmes ont également causé des destructions massives aux laboratoires de recherche. Pendant Ouragan Katrina, de nombreux congélateurs ULT ont perdu de la puissance et se sont réchauffés à température ambiante. À la Louisiana State University (LSU), 100 % des animaux hébergés dans des animaleries ont été perdus. Décès d'animaux similaires ont été examinés au centre médical NYU Langone, à la suite du passage de l'ouragan Sandy à New York.

Procédures de sécurité des laboratoires : renforcer la résilience grâce à la numérisation

Rien ne peut inverser l'impact de ces situations douloureuses et tristes.

Et même si nous ne serons peut-être jamais en mesure de contrôler la météo, il existe des moyens de minimiser l'impact des événements imprévus mentionnés ci-dessus.

La pérennisation de votre laboratoire contre les catastrophes repose sur la numérisation des opérations du laboratoire. Voici trois éléments à prendre en compte pour faire évoluer votre laboratoire vers une stratégie « entièrement numérique ».

Implémentez une plateforme de laboratoire numérique dans votre flux de travail

Pour reconstruire après la perte d'échantillons, de modèles animaux ou de données, vous et votre équipe devrez probablement régénérer les échantillons ou les modèles, répéter les expériences, répliquer et réanalyser les données. Cela nécessite un accès rapide et sans entrave au protocole, aux échantillons et aux données expérimentales.

Les plateformes numériques et les bases de données permettent d'organiser et de stocker efficacement les données expérimentales, ce qui facilite la localisation et la récupération des informations archivées en cas de besoin. En outre, la numérisation favorise collaboration et connaissances partager entre chercheurs, favoriser l'échange d'idées et accélérer la récupération et la réplication d'échantillons, de modèles et de données perdus.

De nombreuses plateformes numériques utilisent le cloud computing et les technologies de stockage, ce qui permet d'accéder facilement aux informations des laboratoires partout dans le monde. Ainsi, si vous devez évacuer votre laboratoire en raison d'une catastrophe naturelle, accéder à vos données est aussi simple que de vous connecter à la plateforme une fois en sécurité.

Gestion et suivi des échantillons

Si un congélateur tombe en panne, comme cela peut se produire dans les situations réelles décrites ci-dessus, vous devrez rapidement déplacer les échantillons vers des congélateurs fonctionnels et hiérarchiser vos échantillons les plus importants. Si vous perdez des échantillons, vous devrez accéder à toutes les métadonnées associées à ces échantillons afin de pouvoir répéter les expériences et les générer à nouveau.

Les plateformes numériques fournissent des bases de données centralisées contenant des informations sur des échantillons, notamment l'emplacement, les conditions de stockage et les données connexes, qui peuvent être enregistrées et facilement accessibles. Systèmes de suivi par codes-barres ou RFID permettre une identification efficace des échantillons, réduisant ainsi le risque d'erreurs et de mauvais placements. Les chercheurs peuvent suivre les échantillons tout au long de leur cycle de vie, de la collecte au stockage, en passant par l'analyse et l'élimination, en garantissant une manipulation appropriée. Ainsi, en cas de problème de congélation, vous pouvez rapidement localiser vos échantillons les plus essentiels et les remettre dans des conditions de stockage optimales.

Former le personnel des laboratoires à la numérisation

Pour protéger votre laboratoire contre les menaces imprévues, tout le monde, des techniciens de laboratoire aux directeurs de laboratoire, doit être formé et se sentir à l'aise sur votre plateforme numérique de laboratoire. Ainsi, votre équipe peut tirer parti des véritables avantages de la numérisation, tels que l'amélioration de la communication et de la collaboration, l'amélioration de l'intégrité et de la sécurité des données et l'augmentation de la productivité.

Ce type de changement de stratégie ne se produit cependant pas du jour au lendemain. Cela nécessite de la formation, du leadership et une transition régulière vers la numérisation. Nous avons supervisé tellement de laboratoires au cours du processus de transition que nous connaissons les pièges les plus courants et avons a élaboré un processus pour les atténuer. Lorsque tout le monde dispose d'une plateforme de laboratoire numérique et sait comment l'utiliser, l'efficacité au quotidien augmente et vous offrez à votre laboratoire une préparation complète pour faire face à des échantillons imprévus ou à des pertes de données.

Optez pour la sécurité en laboratoire et sécurisez votre parcours numérique

Les événements imprévus et les catastrophes peuvent dévaster vos travaux de laboratoire, entraînant une perte d'échantillons, de données et de progrès de la recherche. Bien que nous ne puissions pas envisager l'avenir, nous pouvons prendre certaines mesures pour protéger nos laboratoires et minimiser l'impact de tels incidents imprévisibles.

Pour assurer la pérennité de votre laboratoire contre les pertes, vous devez adopter pleinement la numérisation. En mettant en œuvre un carnet de laboratoire numérique, vous pouvez stocker et récupérer efficacement les données expérimentales, faciliter la collaboration et accélérer la restauration et la réplication des échantillons et des données perdus.

Si vous souhaitez en savoir plus sur la façon dont ELAB Suivant ou Échantillon 360 peut vous aider à rationaliser et à protéger les opérations de votre laboratoire en cas de circonstances imprévues, planifiez un démo personnelle aujourd'hui!

La numérisation envahit notre vie personnelle et professionnelle.

Aujourd'hui plus que jamais, les organisations du secteur des sciences de la vie sont numériser leurs outils de laboratoire et leurs opérations de recherche pour accroître l'efficacité, améliorer la gestion des données, favoriser la collaboration et garantir la sécurité des données.

L'application de l'intelligence artificielle (IA) et de l'apprentissage automatique (ML) s'est également généralisée, permettant ainsi de mieux comprendre et de répondre aux grandes (mais difficiles) questions biologiques auxquelles nous sommes confrontés aujourd'hui.

Ce billet de blog explorera les défis croissants en matière de gestion des données auxquels sont confrontés les universités, l'industrie, les gouvernements et les organisations de recherche à but non lucratif dans notre ère en évolution rapide de l'IA, de l'automatisation et de la multi-omique.

La nécessité d'une solution numérique pour « tout » dans le laboratoire des sciences de la vie

Le besoin d'une solution de laboratoire numérique complète est devenu plus évident à mesure que les données de recherche sont de plus en plus dispersées entre les différents systèmes d'analyse des données et de gestion de l'information. Dans le paysage dynamique actuel, les organisations recherchent une plateforme plus centralisée pour superviser « tout » dans un laboratoire de sciences de la vie : données, échantillons, protocoles, entrées dans des blocs-notes, réactifs, inventaires, instruments, etc.

En outre, la demande d'interopérabilité et d'intégration fluide avec d'autres systèmes augmente rapidement, tout comme la nécessité de se conformer à des exigences en constante évolution en matière de gouvernance de la recherche, d'éthique, de sécurité des données et de formation.

Pour relever ces défis efficacement, la transition des cahiers de laboratoire en papier traditionnels aux cahiers de laboratoire électroniques (ELN) a débuté il y a plus de vingt ans et s'accélère et se développe aujourd'hui à l'échelle mondiale. Adopter un L'ELN offre de nombreux avantages, notamment des interfaces conviviales, des mesures de sécurité renforcées et une compatibilité avec d'autres systèmes.

En numérisant les processus des laboratoires, les progrès scientifiques et les publications devraient augmenter, la conformité réglementaire s'améliorer et la satisfaction au travail et les expériences d'apprentissage des étudiants seront améliorées.

Il est important de noter que le succès et l'impact de la numérisation des laboratoires dépendent des pratiques internes de gestion du changement, de la standardisation des processus et de solides structures de formation et de support pour les utilisateurs finaux.

Une fois ces éléments en place, les organisations des sciences de la vie peuvent tirer pleinement parti du potentiel des solutions de laboratoire numériques et s'engager dans la transformation vers un environnement de recherche plus efficace.

Comment les plateformes de laboratoires numériques aident-elles les opérations et la gestion de la recherche ?

Les plateformes de laboratoires numériques peuvent bénéficier aux laboratoires des sciences de la vie de nombreuses manières. Nous passons ici en revue quelques publications clés qui fournissent des données fiables pour étayer les avantages de l'utilisation de plateformes de laboratoire numériques.

Sortie de données de qualité plus rapide et plus juste

Lorsqu'ils sont utilisés efficacement, les ELN augmentent considérablement la vitesse de collecte, d'analyse et de collaboration des données.

Les chercheurs qui ont mis en œuvre avec succès les ELN ont rapporté achèvement plus rapide des expériences de recherche par rapport aux carnets en papier traditionnels. Cela s'explique en partie par le fait que les équipements de recherche modernes génèrent des données numériques, ce qui permet une intégration parfaite avec les ELN.

UNE 2022 La nature article a souligné que l'utilisation des eLN permet de consacrer plus de temps à la recherche proprement dite en réduisant le temps nécessaire à la collecte des données, à l'analyse et à la préparation des manuscrits. Pouvez-vous imaginer le temps que vous pourriez gagner si vous n'aviez pas à imprimer les données sur du papier, à couper l'excédent avec des ciseaux et à les coller ou à les coller sur un carnet de laboratoire en papier ? En outre, la numérisation des processus de laboratoire facilite la standardisation de la collecte et de l'analyse des données, favorisant ainsi la transparence et la reproductibilité des expériences.

Un autre défi auquel sont confrontés les scientifiques et les chercheurs est de faciliter la découverte de connaissances sur les données scientifiques et les flux de travail et algorithmes associés par les machines et les humains. Pratiques relatives aux données FAIR définir des principes pour rendre les données trouvables, accessibles, interopérables et réutilisables, facilitant ainsi le flux de données sans entrave vers l'ensemble de la communauté scientifique. Grâce à l'eLN, vous pouvez documenter toutes les configurations des appareils, planifier des expériences, enregistrer des données d'expériences numériques et ajouter des observations humaines ou analogiques, permettant ainsi aux chercheurs de se conformer aux pratiques en matière de données FAIR de manière fluide.

Outre ces avantages, certains fournisseurs d'ELN proposent des interfaces de programmation d'applications (API) et des kits de développement logiciel (SDK) qui permettent aux utilisateurs de connecter leur ELN à d'autres plateformes et systèmes logiciels de recherche, tels que Microsoft 365, GraphPad Prism et d'autres logiciels tiers.

Ces intégrations rationalisent les flux de travail, minimisent les erreurs et les doublons et facilitent le transfert ou le partage de données entre les plateformes.

La numérisation des laboratoires améliore les résultats de la recherche et pérennise vos processus en facilitant une intégration plus poussée et en s'adaptant à l'évolution des exigences interopérationnelles. En adoptant les ELN, les chercheurs peuvent bénéficier d'une accélération des progrès de la recherche tout en établissant une base solide pour leurs activités scientifiques en cours.

Conformité réglementaire accrue

Au-delà des avantages évidents tels que la protection des données sensibles, de la propriété intellectuelle et des brevets, une excellente plateforme de laboratoire numérique garantit le respect des normes légales et de cybersécurité ; les ELN peuvent également renforcer la conformité aux réglementations en matière de gestion des risques biologiques et des matières dangereuses.

Par exemple, les ELN peuvent inclure des fonctionnalités qui facilitent la manipulation, le stockage et l'élimination appropriés des matières biologiques et dangereuses. Ils fournissent des pistes d'audit et génèrent des rapports, simplifiant ainsi les démonstrations de conformité lors des inspections ou des audits. En outre, les ELN permettent une organisation basée sur les projets et les utilisateurs, au lieu de se contenter de l'organisation rigide et traditionnelle basée sur les utilisateurs que l'on retrouve dans les cahiers de laboratoire en papier. Ainsi, les protocoles, les échantillons et les données de plusieurs personnes travaillant sur un projet spécifique sont accessibles depuis un seul endroit au sein de l'ELN. Cela permet un suivi plus précis des opérations, car il peut y avoir un roulement de personnel au cours d'un projet ou de la préparation d'un manuscrit.

Dans une critique publié dans le Journal de biosécurité et de biosécurité, Soleil et coll. recommandent d'utiliser des plateformes de laboratoire numériques pour garantir la sécurité, l'efficacité et la conformité aux réglementations de gestion des risques biologiques dans les laboratoires de biosécurité (BSL).

Ces solutions numériques rationalisent la collecte de données, suivent le mouvement des échantillons biologiques et chimiques et tiennent à jour les procédures opérationnelles standard. Les ELN offrent des interfaces simples et des fonctionnalités personnalisables pour relever les défis, tels que les échantillons génétiquement modifiés (GM), les échantillons radioactifs ou les matériaux cytotoxiques.

En adoptant les ELN et d'autres solutions de laboratoire numériques, les chercheurs peuvent améliorer la conformité aux réglementations en matière de gestion des risques biologiques, améliorer la traçabilité des données et rationaliser les processus liés à la manipulation des matières dangereuses.

Amélioration de l'expérience du personnel de laboratoire et des étudiants

Les ELN offrent un moyen fiable et efficace de tenir à jour les registres des expériences et des données de recherche. Dotées de fonctionnalités numériques, ces solutions permettent aux scientifiques de collecter, d'organiser, modéliser, et analysez les données avec une efficacité accrue. Cela permet de gagner du temps et de garantir que les informations sont facilement accessibles en cas de besoin.

Un autre avantage notable des ELN est leur impact positif sur les expériences d'apprentissage des étudiants. Recherche depuis Riley et coll. a montré que les ELN facilitent l'apprentissage en laboratoire. Les étudiants bénéficient davantage de la rapidité de la recherche et de la récupération d'informations, de la rationalisation de leur flux de travail et du sentiment d'engagement et de motivation accrus dans leur travail. Les ELN soutiennent également l'apprentissage en équipe, en favorisant la collaboration et le partage des connaissances entre les étudiants.

En plus de soutenir l'apprentissage des étudiants, les ELN renforcent la collaboration interdisciplinaire et le partage des connaissances entre les chercheurs. Ils permettent aux scientifiques de collaborer plus efficacement avec des partenaires externes, facilitant le transfert de connaissances et d'expertise et améliorant la productivité et l'efficacité du laboratoire.

En automatisant les tâches de routine telles que la saisie des données, les calculs et la génération de rapports, les scientifiques peuvent consacrer plus de temps à des activités de recherche de grande valeur. Les ELN interopérables avec d'autres systèmes devraient notamment apporter une valeur ajoutée au travail quotidien du personnel de laboratoire, car ils rationaliseront davantage les flux de travail.

Bien que l'adaptation au changement puisse être difficile pour les utilisateurs finaux, les avantages d'un environnement de laboratoire numérique, soutenu par une formation et un soutien appropriés, auront sans aucun doute un impact positif et durable sur l'expérience du personnel de recherche et des étudiants travaillant dans les laboratoires.

Conclusion

En conclusion, les cahiers de laboratoire électroniques sont utiles aux organisations en ce qui concerne la gestion et les opérations de recherche. Alors que l'utilisation des ELN et numérisation des laboratoires dépend du déploiement interne et de la structure de support de ces changements systémiques, les preuves suggèrent qu'ils peuvent :

1. Contribuez à des processus de recherche plus efficaces et collaboratifs, ce qui peut à terme accélérer les délais de publication.
2. Facilitez la conformité grâce à une amélioration du suivi, de la documentation et des audits.
3. Améliorez l'expérience de laboratoire des étudiants et du personnel de laboratoire en réduisant leur charge de travail administrative et en libérant du temps pour leur travail de grande valeur (c'est-à-dire effectuer des recherches et des analyses de données et préparer des manuscrits).

Notre produit, eLabJournal, est bien plus qu'un simple ELN. Il s'agit d'une plateforme de laboratoire numérique (DLP) complète tout-en-un qui permet de gérer vos données de recherche, vos protocoles et votre inventaire, tout en ayant la capacité de s'intégrer aux systèmes de recherche existants.

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Si vous lisez ceci, vous utilisez probablement un ordinateur de bureau, une tablette ou un téléphone.

Nous prenons souvent pour acquis le fonctionnement interne complexe de ces appareils, mais ce qu'ils font est incroyable, car ils gèrent les entrées et les sorties d'un large éventail de logiciels et de matériels.

Et au centre de tout cela se trouve le système d'exploitation (OS), un logiciel essentiel qui communique avec l'unité centrale (CPU), le disque dur, la mémoire et d'autres logiciels, en les intégrant pour que votre appareil puisse fonctionner correctement. Il vous permet également, en tant qu'utilisateur, de communiquer avec votre ordinateur, votre tablette ou votre téléphone et d'effectuer des tâches via une interface visuelle simple sans connaître la langue de votre appareil.

Bien que la fonction de base soit la même, tous les systèmes d'exploitation ne sont pas créés de la même manière : le système d'exploitation d'Apple offre une interface visuellement époustouflante mettant l'accent sur la simplicité et l'intégration. Dans le cas du système d'exploitation de Microsoft, les hautes performances, la sécurité et la facilité d'utilisation sont les priorités.

Ces dernières années, mon équipe et moi avons imaginé un monde dans lequel un système d'exploitation pourrait exister dans un laboratoire de sciences de la vie. Au lieu d'utiliser un programme différent pour chaque instrument, tous les instruments et équipements pouvaient être accessibles et contrôlés à l'aide d'une interface logicielle unique sans connaissance préalable des spécificités de leur fonctionnement interne, portant ainsi l'automatisation des laboratoires à un niveau supérieur. Cette possibilité rendrait l'expérimentation accessible au personnel de tous niveaux d'expérience et permettrait de gagner énormément de temps à l'échelle du laboratoire, du département et de l'organisation.

Dans le blog suivant, nous approfondirons l'automatisation des laboratoires, les limites actuelles des instruments automatisés et la manière dont notre mission, à savoir créer un « système d'exploitation de laboratoire », peut apporter la prochaine génération de recherches en sciences de la vie.

Principes de base et avantages de l'automatisation des laboratoires

Au cours des dernières décennies, le nombre d'instruments automatisés sophistiqués de manipulation et d'analyse des liquides a augmenté, dotant les scientifiques d'outils puissants leur permettant de mieux comprendre le monde qui nous entoure.

L'automatisation des laboratoires repose sur trois composants essentiels qui la rendent possible :

• Systèmes robotiques : Les systèmes robotiques peuvent effectuer un large éventail de tâches de laboratoire de routine, notamment la manipulation de liquides, la préparation d'échantillons, la manipulation de plaques et le traitement des tests. Ces systèmes automatisés sont équipés de mécanismes et de capteurs précis qui leur permettent de manipuler de petits volumes de liquide, de distribuer des réactifs avec précision et d'effectuer des étapes de pipetage répétitives avec une grande précision. Ils peuvent travailler 24 heures sur 24, avec un minimum de temps de manipulation, ce qui accélère le rythme des expérimentations et augmente la productivité.
• Logiciel de l'instrument : Le matériel robotique est essentiel mais il est inutile sans un logiciel qui lui indique ce qu'il doit faire et fournit à l'utilisateur un portail pour le contrôler. Les logiciels d'automatisation permettent de contrôler et de coordonner divers instruments et appareils dans le laboratoire. Il permet la conception et l'exécution de protocoles expérimentaux complexes, la planification des tâches et le suivi des performances des instruments.
• Systèmes de gestion et d'analyse des données : Les systèmes de gestion et d'analyse des données facilitent le stockage, la récupération et l'analyse des données expérimentales générées par certains instruments, ce qui permet aux scientifiques de gérer et d'interpréter plus facilement de grands volumes d'informations. Selon la plateforme, un système de gestion des données peut être un simple « poney à un tour » ou un solution de bout en bout pour l'ensemble du cycle de vie des données.

En fin de compte, la combinaison de ces trois composants dans un réglage d'instrument automatisé capable de tout effectuer, de la préparation des échantillons à l'analyse, présente des avantages significatifs pour de nombreux laboratoires, notamment :

• Reproductibilité améliorée : La crise de la reproductibilité dans les sciences et les facteurs qui y contribuent constituent depuis longtemps une aubaine pour l'avancement de la recherche. Les systèmes robotiques résolvent plusieurs de ces problèmes en effectuant des tâches avec une grande précision, en réduisant le risque d'erreur humaine (sans toutefois l'éliminer) et en améliorant la qualité des données. Les processus automatisés facilitent également la réplication des expériences, permettant aux chercheurs d'obtenir des résultats fiables et reproductibles, essentiels pour les avancées scientifiques et la conformité réglementaire.
• Rentabilité à long terme : Bien que l'automatisation des laboratoires nécessite un investissement initial relativement important, elle peut permettre de réaliser d'importantes économies à long terme. En augmentant le débit et la productivité, l'automatisation optimise l'utilisation des ressources, réduit les coûts de main-d'œuvre et minimise le besoin de réactifs et de consommables. En outre, l'automatisation réduit le risque d'erreurs coûteuses et de retouches, améliorant ainsi l'efficacité opérationnelle et la rentabilité.
• Sécurité et atténuation des risques : En minimisant l'exposition aux matières dangereuses et aux microtraumatismes répétés associés à la manipulation manuelle, l'automatisation des laboratoires contribue à atténuer les risques pour la sécurité du personnel. Les systèmes automatisés peuvent manipuler des substances potentiellement dangereuses et effectuer des tâches dans des environnements contrôlés, réduisant ainsi les risques d'accidents et garantissant un environnement de travail plus sûr.
• Découverte accélérée : L'automatisation accélère le processus de R&D, permettant aux scientifiques de mener des expériences plus rapidement. En permettant de traiter un grand nombre d'échantillons et de réaliser des expériences à haut débit, l'automatisation facilite la génération et l'analyse rapides des données. Ce flux de travail accéléré accélère les découvertes scientifiques, stimule l'innovation et accélère la traduction des résultats de la recherche en applications pratiques.
• Standardisation et conformité : L'automatisation permet d'établir des protocoles et des procédures normalisés, garantissant ainsi la cohérence entre les expériences et les laboratoires. Cette standardisation est cruciale dans les environnements réglementés, où le respect de normes de qualité et d'exigences réglementaires strictes est nécessaire. L'automatisation permet un contrôle précis des paramètres expérimentaux, de la collecte de données et de la documentation, simplifiant ainsi la conformité réglementaire et les processus d'audit.
• Gestion des données améliorée : L'automatisation s'intègre à des systèmes logiciels sophistiqués pour capturer, analyser et stocker les données de manière fluide. Cela élimine la saisie manuelle des données, réduit les erreurs de transcription et améliore l'intégrité des données. La gestion automatisée des données permet de surveiller et de suivre en temps réel les progrès des expériences, ce qui garantit une organisation et une extraction efficaces des données et facilite la prise de décisions fondées sur les données.

Limites de l'écosystème actuel d'automatisation des laboratoires

Bien que les avantages de l'automatisation soient évidents, certaines limites demeurent.

Limite #1 : Expérience scientifique et exigences de formation spécifiques à l'instrument

Travailler avec les instruments et équipements de laboratoire automatisés actuels nécessite une compréhension approfondie de la manière dont les protocoles manuels des sciences de la vie sont conçus et mis en œuvre. En outre, une expérience du fonctionnement, des fonctionnalités et des logiciels associés des instruments est nécessaire, et une formation ou une consultation avec un expert technique sont généralement requises avant d'utiliser un instrument. Ces connaissances et cette formation permettent au personnel du laboratoire de prendre des décisions éclairées, de résoudre les problèmes et d'optimiser les performances des systèmes automatisés.

Chaque instrument de laboratoire automatisé possède des fonctionnalités, des protocoles et des interfaces logicielles uniques. Les utilisateurs doivent recevoir une formation spécifique sur l'instrument avec lequel ils travailleront afin de comprendre ses capacités, ses contraintes et ses exigences de maintenance. Les programmes de formation proposés par des fabricants d'instruments ou des organisations tierces familiarisées avec la technologie peuvent aider les utilisateurs à acquérir une expertise dans le fonctionnement efficace de l'instrument spécifique. Cependant, il ne s'agit pas d'une solution à long terme : les stagiaires oublieront leur formation au fil du temps et feront des erreurs.

Limitation #2 : intégration des flux de travail

De nombreux flux de travail et protocoles nécessitent de multiples instruments automatisés dotés de fonctionnalités, de protocoles et de plateformes logicielles uniques. Pour créer un flux de travail cohérent et entièrement automatisé, le personnel du laboratoire doit comprendre le rôle de chaque instrument, ce qui nécessite une formation supplémentaire. En outre, étant donné que de multiples plateformes sont en jeu et qu'aucun système unificateur n'interagit avec elles, une communication et un traitement manuels sont nécessaires pour garantir une intégration, un transfert de données et une analyse fluides.

Limitation #3 : erreur humaine

Les instruments automatisés éliminent de nombreux aspects des erreurs humaines dans le processus de recherche, mais plusieurs étapes sont sujettes aux erreurs. La plupart des systèmes nécessitent des paramètres d'entrée ou des configurations spécifiques pour effectuer les tâches avec précision. Si des erreurs sont commises lors de la configuration du protocole, un instrument peut exécuter par inadvertance les mauvaises étapes à une échelle beaucoup plus grande que s'il était exécuté manuellement. Cela peut entraîner des données erronées, des expériences infructueuses et un gaspillage massif de ressources, de réactifs et de consommables.

Les instruments automatisés nécessitent également un étalonnage et une maintenance réguliers pour garantir des performances précises. Le fait de ne pas étalonner ou entretenir correctement l'équipement peut entraîner des complications en aval et (comme ci-dessus) si une erreur passe inaperçue, elle peut entraîner des résultats inexacts, nécessitant de nouveaux tests et gaspillant des ressources.

Lab OS : lancement de la nouvelle génération en matière d'automatisation

Au début de ce blog, je vous ai demandé d'imaginer un laboratoire entièrement connecté contrôlé par un système d'exploitation de laboratoire.

Comme vous pouvez le constater à la lumière des limites décrites ci-dessus, il est nécessaire de moderniser l'automatisation actuelle des laboratoires. Les systèmes automatisés actuels, avec leur robotique, leurs logiciels et leurs systèmes de gestion des données, sont inutilement complexes.

De plus, le terme « automatisation » de ces instruments n'est pas approprié. L'instrumentation actuelle a considérablement réduit le temps de manipulation par rapport aux protocoles manuels. Pourtant, du personnel qualifié est toujours nécessaire pour les aider à gérer les erreurs et à s'assurer que les protocoles sont exécutés comme prévu.

Pour passer à la prochaine phase de l'automatisation des laboratoires, mon équipe et moi Génie des sciences de la vie ont créé un système d'exploitation de laboratoire unificateur appelé Génie LaBos, permettant la réalisation complète de votre système d'automatisation actuel sans avoir à acheter un tout nouveau parc d'instruments.

Le système d'exploitation est indépendant de l'instrument, ce qui permet aux scientifiques et aux ingénieurs en automatisation de concevoir des protocoles pour tous les instruments et accessoires connectés sans avoir besoin de formation sur un logiciel ou un matériel spécifique à l'instrument. Genie rend l'automatisation des laboratoires accessible en fournissant les détails fastidieux de la disposition de votre terrasse, des conseils et des paramètres de classe de liquide pour une manipulation propre et efficace des liquides.

Ce faisant, le personnel de laboratoire, quel que soit son niveau de compétence, a accès aux fonctionnalités de ses instruments automatisés. La création de protocoles peut être réalisée par simple glisser-déposer. En outre, les essais à sec virtuels permettent de capter la majeure partie de l'intention du chercheur, d'éliminer les erreurs sans avoir à effectuer des essais et des erreurs et de permettre aux utilisateurs de publier des protocoles pour un meilleur partage et une meilleure supervision.

Planifiez une démonstration dès aujourd'hui pour découvrir comment exploiter la prochaine génération de capacités d'automatisation de votre laboratoire.

ElabNext a intégré Outil DMP, une plateforme en ligne gratuite permettant de créer des plans de gestion des données (DMP), dans sa bibliothèque de modules complémentaires pour les plateformes de laboratoire numériques. Grâce à l'ajout de DMPtool, les laboratoires de recherche et leurs institutions affiliées peuvent générer des DMP pour un large éventail d'organisations de financement, y compris le National Institute of Health (NIH), et les consulter ou les télécharger directement depuis le logiciel d'eLabNext, ce qui permet une collaboration plus aisée, la rédaction des demandes de subvention, la soumission des propositions et le maintien de la conformité.

Qu'est-ce que le DMP (Data Management Plan) ?

Un plan de gestion des données (DMP) est un document structuré qui décrit la manière dont les données seront traitées à la fois pendant un projet de recherche et après son achèvement. Il détaille les types de données à collecter, les méthodologies de collecte et d'analyse des données, les plans de partage et de préservation des données et les stratégies visant à garantir la sécurité et la confidentialité des données. Le DMP est essentiel pour préserver l'intégrité des données et garantir que celles-ci peuvent être utilisées efficacement pour de futures recherches, audits ou réplication de l'étude. Les agences de financement, les institutions de recherche et les revues publiées exigent souvent son utilisation pour garantir de bonnes pratiques de recherche et le respect des directives éthiques.

Pourquoi les plans de gestion des données sont-ils importants ?

Une gestion et un partage appropriés des données garantissent que toutes les données scientifiques (et les métadonnées associées) sont repérables, accessibles, interopérables et réutilisables pour la communauté scientifique actuelle et future. Le respect des directives actuelles des agences de financement garantit que les découvertes sont attribuées aux bons scientifiques et permet aux futurs chercheurs de réutiliser les données pour de nouvelles avancées scientifiques.

Le NIH, une source de financement majeure pour les laboratoires de R&D des sciences de la vie, a donné la priorité gestion et partage des données. Ils s'attendent à ce que «... les chercheurs maximisent le partage approprié des données scientifiques, en tenant compte de facteurs tels que les problèmes juridiques, éthiques ou techniques qui peuvent limiter l'étendue du partage et de la préservation des données ». En conséquence, le NIH a publié de nombreuses ressources et documents politiques que tous les bénéficiaires de subventions du NIH peuvent mettre en œuvre dans leurs opérations, avec un mise à jour récente à la politique début 2023.

Cependant, la rédaction et la soumission d'un plan de gestion et de partage des données, désormais exigées par de nombreux autres organismes de financement publics et privés, constituent un défi, car elles nécessitent des descriptions détaillées des types de données, des méthodes d'analyse, des normes qui seront suivies, des délais de conservation et d'accès aux données, des obstacles potentiels et de la manière dont la conformité sera vérifiée et garantie. En outre, les différentes agences de financement ont des exigences uniques qui sont constamment mises à jour, ce qui met la pression sur les chercheurs individuels et leurs organisations universitaires, à but non lucratif, gouvernementales ou industrielles pour qu'ils effectuent des contrôles de qualité avant la soumission afin de garantir le respect des directives actuelles de chaque agence de financement. Enfin, une fois les subventions accordées, il peut être difficile pour tout le personnel du laboratoire d'accéder aux DMP et de les comprendre, ce qui entraîne des pratiques de gestion des données non conformes et, potentiellement, des pertes de données.

Qu'est-ce que DMPtool et comment fonctionne-t-il

DMPtool, une plate-forme Web gratuite et open source, permet aux chercheurs de rédiger des plans de gestion des données et de partager des plans conformes aux agences de financement en fournissant un modèle de DMP simple et spécifique à chaque agence. L'assistant d'écriture rationalise l'écriture en interrogeant un utilisateur sur chaque élément de son DMP et en fournissant des exemples de réponses dans une interface facile à utiliser. En décomposant les éléments requis, DMPtool facilite et simplifie les demandes de subventions.

En outre, plus de 380 institutions et organisations ont mis en œuvre DMPtool dans le cadre de leur processus d'évaluation des demandes de subvention, permettant aux utilisateurs affiliés d'accéder à des modèles et à des ressources spécifiques à l'organisation, au texte et aux réponses suggérés, ainsi qu'à une assistance supplémentaire pour faciliter davantage l'examen et l'approbation internes. DMPtool propose également des liens directs vers les sites Web des organisations de financement afin de garantir que la plateforme est à jour avec les dernières exigences et les meilleures pratiques.

Ces avantages ont conduit à l'adoption généralisée de DMPtool, plus de 96 000 chercheurs ayant utilisé l'application en ligne pour soumettre plus de 92 000 DMP.

Examen efficace des propositions, soumission et mise en œuvre du plan de gestion des données grâce à l'intégration d'eLabNext

ELAB Suivant fournit une solution logicielle flexible et multidimensionnelle répondant aux besoins en constante évolution des laboratoires des sciences de la vie. L'une des caractéristiques déterminantes de la plateforme est sa capacité à étendre ses fonctionnalités. L'ajout du DMPTool à notre bibliothèque de modules complémentaires eLabMarketplace en est l'exemple le plus récent et a été demandé par École de médecine de Harvard (HMS) utilisateurs des deux plateformes.

L'intégration de DMPtool à eLabNext permettra aux utilisateurs de HMS et d'autres entités d'extraire des DMP de DMPtool et de présenter des résumés de plans dans eLabNext, ainsi qu'un lien pour télécharger le plan complet. Par conséquent, tout utilisateur d'eLabNext peut accéder au DMP et à la référence pendant qu'il effectue des recherches. Cela profite aux chercheurs en les aidant à maintenir la conformité et en facilitant la gestion complète du cycle de vie du DMP, depuis le processus de rédaction des demandes de subvention jusqu'à la période suivant l'attribution.

Essayez DMPTool dans le cadre d'un essai gratuit

À propos de DMPtool

Outil DMP est une plateforme en ligne gratuite et ouverte conçue pour aider les chercheurs à créer et à gérer des plans de gestion et de partage des données. Il fournit une collection de modèles et de ressources, des conseils étape par étape et des exemples complets pour guider les chercheurs tout au long du processus d'élaboration de PGD efficaces, conformes aux exigences et aux meilleures pratiques des bailleurs de fonds.

Qu'il s'agisse de biobanques contenant des millions d'échantillons biologiques ou de votre laboratoire universitaire de biologie moléculaire, le suivi des échantillons et l'entreposage frigorifique sont essentiels pour garantir l'efficacité et la rationalisation des opérations de laboratoire. Et le congélateur à très basse température (ULT) est la pierre angulaire de ce processus essentiel.

En conservant les échantillons biologiques ou les biomolécules à des températures stables allant de -70 ℃ à -196 ℃, les congélateurs ULT préservent l'intégrité et la qualité des échantillons en limitant la dégradation et l'activité biologique. Cela nécessite une ingénierie impressionnante qui repose sur une isolation de haute qualité, des compresseurs puissants, des systèmes avancés de contrôle de la température et des systèmes de secours pour garantir une protection contre les pannes de courant ou les fluctuations de température.

Ce travail a un coût : il nécessite beaucoup d'énergie. On estime qu'un seul congélateur ULT consomme environ 20 kWh/jour, soit à peu près la même quantité qu'une maison unifamiliale aux États-Unis. Avec une telle consommation d'énergie, les congélateurs ULT sont devenus un élément central de la discussion croissante sur la réduction de l'impact environnemental des laboratoires des sciences de la vie et sur l'évolution de l'industrie dans une direction plus durable.

Les congélateurs ULT ont considérablement évolué, passant de leur format initial de « rectangle froid » à des modèles plus raffinés, élégants et économes en énergie. Mais ils ne constituent qu'une pièce du puzzle de la durabilité. Dans le blog suivant, nous abordons la durabilité d'un point de vue holistique, en examinant les différents obstacles à un stockage frigorifique plus respectueux de l'environnement et solution de gestion des échantillons de laboratoire et comment nous envisageons l'avenir de la durabilité dans les sciences de la vie au-delà du congélateur ULT.

Améliorer la gestion des échantillons dans les laboratoires écologiques : le problème énergétique des congélateurs ULT

Pour comprendre l'étendue complète de l'utilisation des congélateurs ULT à énergie, nous avons besoin de mieux comprendre les problèmes actuels de votre laboratoire typique et les obstacles à une gestion plus efficace des échantillons de chambres froides. Au cours des décennies que j'ai passées dans le domaine des sciences de la vie, j'ai été confrontée à plusieurs problèmes courants liés à l'utilisation de congélateurs ULT.

Échantillons inconnus

À Eppendorf, nous avons estimé et constaté de première main qu'environ 25 % des congélateurs contiennent des échantillons sans valeur pour personne. Il peut s'agir d'informations manquantes, complètement oubliées ou utilisées pour la dernière fois par du personnel qui a quitté le laboratoire pour d'autres fonctions. Par conséquent, personne dans le laboratoire ne les a touchés depuis des années.

Alors pourquoi restent-ils ? De nombreux laboratoires accumulent ces échantillons inconnus ou oubliés parce que leur élimination demande du temps et de l'énergie. On craint également de détruire des échantillons qui sont, à l'insu du personnel actuel, précieux et irremplaçables.

Problèmes liés à l'immobilier

L'accumulation d'échantillons anciens et inconnus rend les espaces de congélation désorganisés et source de confusion pour le personnel actuel et futur. En outre, ces échantillons occupent de précieux espaces de congélation, obligeant les directeurs de laboratoire à acheter de nouveaux congélateurs pour accueillir de nouveaux échantillons.

Pensez à ajouter 2 à 3 nouveaux congélateurs par an à votre laboratoire pour stocker de nouveaux échantillons lorsqu'il y a suffisamment d'espace occupé par des échantillons inutiles.

Cela représente une consommation d'énergie supplémentaire de 40 à 60 kWh/jour et un supplément de 20 000 à 40 000 dollars par an que votre laboratoire doit prendre en compte dans son budget.

Durée de vie réduite du congélateur et intégrité des échantillons

Combien de temps vous faut-il pour localiser et prélever vos échantillons chaque fois que vous ouvrez votre congélateur ULT ?

15 secondes ? Une minute ?

Lorsque votre congélateur est jonché d'échantillons désorganisés ou inconnus, le temps est forcément plus long. Voici un aperçu de ce qui peut se passer chaque fois que vous ouvrez votre congélateur :

• Hausse de température : Lorsque vous ouvrez la porte d'un congélateur, de l'air chaud entre. L'air chaud fera monter la température à l'intérieur du congélateur. Le taux d'augmentation de la température dépendra de la quantité d'air chaud qui entre, elle, est proportionnelle à la durée d'ouverture de votre congélateur. À mesure que la température augmente, l'intégrité des échantillons peut être menacée.
• Condensation : L'air chaud et humide qui pénètre dans votre congélateur peut se condenser sur les surfaces froides à l'intérieur du congélateur, y compris les étagères, les parois et les échantillons.
• Accumulation de givre : L'air chaud qui entre dans le congélateur peut provoquer une accumulation de givre sur les serpentins de l'évaporateur, ce qui peut réduire l'efficacité de refroidissement du congélateur et provoquer de nouvelles fluctuations de température. Le givre peut également se condenser sur la porte du congélateur et, dans des situations extrêmes, empêcher la fermeture de la porte, nécessitant un couple extrême pour fermer la poignée mécanique de la porte du congélateur.
• Surcharge du compresseur : Lorsque de l'air chaud entre dans le congélateur, le compresseur doit travailler plus fort pour maintenir la température réglée. Plus la porte est ouverte longtemps, plus le compresseur doit fonctionner. Cela peut entraîner une surcharge du compresseur, ce qui peut endommager ou endommager le congélateur ULT.

Les problèmes ci-dessus ne font qu'augmenter au fur et à mesure que votre congélateur est ouvert. Cela réduit en fin de compte la durée de vie de votre congélateur et des échantillons qu'il contient.

Améliorer la durabilité : solution de gestion des échantillons pour congélateurs ULT

Les problèmes ci-dessus trouvent leur origine dans des pratiques inefficaces de suivi et de gestion des échantillons. En fin de compte, ils entraînent une baisse de productivité, une augmentation des coûts d'exploitation et une augmentation de la consommation d'énergie. Bien qu'il n'existe aucun moyen rétrospectif de déterminer quels sont les anciens échantillons qui obstruent vos congélateurs, nous pouvons vous aider à faire en sorte que tous les nouveaux échantillons soient correctement catalogués, suivis et stockés afin d'éviter la perpétuation de pratiques de laboratoire gourmandes en énergie.

Chez Eppendorf et ElabNext, nous avons développé une solution de stockage frigorifique de bout en bout, Échantillon 360, qui permet la protection, le stockage, le suivi et la surveillance des échantillons à l'aide d'un outil facile à utiliser plateforme de laboratoire numérique. En plus de notre système de codes-barres, RackScan, et de notre logiciel de gestion des échantillons conforme aux BPL, eLabInventory, nous aidons leurs congélateurs ULT à rester organisés et, par conséquent, à les rendre plus durables.

Pour voir Sample360 en action, planifiez une démonstration personnelle aujourd'hui !

Veuillez faire défiler la page vers le bas pour la traduction en anglais

Do caderno de anotações ao software de gerenciamento, a migração do papel ao digital é global, e acontece em todas as áreas. O investimento em digitização de laboratórios de pesquisa nas universidades, P&D, biotechs ou pequenas empresas possui grande potencial crescimento, no entanto, ainda se encontram em fase inicial. Por que a digitalização está demorando tanto para acontecer na América Latina ?

Tout d'abord, précisamos voltar um pouco no time. Em 2019, a pandemia escancarou que muitos ramos da biotecnologia precisavam acelerar a transformação digital, para chegar perto da taxa de desenvolvimento, por exemplo, da indústria de diagnóstico ou farmacêutica. Além disso, a perspectiva socioeconômica herdada pós-covid não era das melhores. Pequenas empresas foram as mais afetadas e vivenciamos um cenário acentuado e complexo devido as debilidades estruturais existentes na região, reforçando a necessidade de explorar cada vez mais a transformação digital para fortalecer as instituições¹.

Como observamos o mercado mais desenvolvido na digitalização é o mercado diagnóstico. Um exemplo é uma das maiores empresas na America Latina, o DASA - Diagnósticos da América S.A. — que investiu milhões para a transformação digital para melhor atendimento ao paciente e redução de custo de operação². Essa mesma lógica pode se aplicar aos laboratórios de pesquisa, biotechs e statups no Brasil, que também tem sido uma tendência crescente nos últimos anos, com a adoção de tecnologias digitais para aprimorar a coleta, análise, armazenamento e compartilhamento de dados. Hoje, revistas cientificas de relevância exigem o compartilhamento de dados brutos para publicação³ Et imaginez que vous pouvez obtenir partilhar com apenas um clique ? Ou acessar dados do lab em qualquer lugar do mundo.

Não podemos negar que com a realidade da região sempre teremos que contar com as instabilidades socioeconômica e política gerando inseguranças sobre os investimentos que serão injetados nas universidades e startups. Investir ou planejar o seu projeto considerando soluções de software é uma ação que torna esse ambiente mais sustentável e é essencial para a saúde e manutenção do lab. E que o investimento - conseguido com muito suor - seja aplicado de forma otimizada trazendo maior produtividade e inteligência na utilização de recursos e pessoas e garantindo que os dados e amostras sejam protegidas e armazenadas com segurança.

Você está preparado para abandonar o seu caderno e viver uma nova era ?

Referências bibliográficas :

1. Perspectivas Económicas de América Latina 2020 : transformation numérique pour une meilleure reconstruction
2. 2022 : as contribuições da Dasa para entregar mais saúde aos brasileiros
3. Nature : le partage des données, c'est l'avenir

Comment la numérisation peut optimiser les laboratoires en Amérique latine

Des ordinateurs portables aux logiciels de gestion, la migration du papier vers le numérique est mondiale et se produit dans tous les domaines. Les investissements dans la numérisation des laboratoires de recherche des universités, de la R&D, des biotechnologies ou des petites entreprises présentent un fort potentiel de croissance, mais n'en sont qu'à leurs débuts. Pourquoi la numérisation met-elle tant de temps à se produire en Amérique latine ?

Tout d'abord, il faut remonter un peu dans le temps. En 2019, la pandémie a clairement montré que de nombreuses branches de la biotechnologie devaient accélérer leur transformation numérique, pour se rapprocher du taux de développement de l'industrie diagnostique ou pharmaceutique, par exemple. De plus, les perspectives socio-économiques héritées de l'après-covid n'étaient pas les meilleures. Les petites entreprises ont été les plus touchées et nous avons été confrontés à un scénario difficile et complexe en raison des faiblesses structurelles existantes dans la région, ce qui renforce la nécessité d'exploiter de plus en plus la transformation numérique pour renforcer les institutions¹.

Comme nous l'avons observé, le marché le plus développé en matière de numérisation est le marché du diagnostic. L'une des plus grandes entreprises d'Amérique latine, DASA - Diagnósticos da América S.A., en est un exemple. Elle a investi des millions dans la transformation numérique afin d'améliorer les soins aux patients et de réduire les coûts d'exploitation². Cette même logique peut être appliquée aux laboratoires de recherche, aux biotechnologies et aux startups au Brésil, qui a également connu une tendance croissante ces dernières années, avec l'adoption de technologies numériques pour améliorer la collecte, l'analyse, le stockage et le partage des données. Aujourd'hui, les revues scientifiques pertinentes nécessitent le partage de données brutes pour publication³ et imaginez pouvoir partager en un seul clic ? Ou accédez aux données de laboratoire où vous soyez dans le monde.

Nous ne pouvons nier qu'avec la réalité de la région, nous devrons toujours faire face à des instabilités socio-économiques et politiques qui génèrent une insécurité quant aux investissements qui seront injectés dans les universités et les startups. Investir ou planifier votre projet en envisageant des solutions logicielles est une action qui rend cet environnement plus durable et qui est essentielle à la santé et à la maintenance du laboratoire. Et que l'investissement, réalisé avec beaucoup de sueur, soit appliqué de manière optimisée, en augmentant la productivité et l'intelligence dans l'utilisation des ressources et des personnes, et en garantissant la protection et le stockage des données et des échantillons en toute sécurité.

Êtes-vous prêt à abandonner votre carnet et à vivre une nouvelle ère ?

Tous les scientifiques connaissent la frustration que représente le fait de fouiller dans d'innombrables feuilles de calcul Excel et blocs-notes en papier à la recherche désespérée de données cruciales, de détails expérimentaux oubliés et de localisations critiques de réactifs. Comme nous l'avons déjà dit, numérisation de votre laboratoire c'est comment contourner ces problèmes.

Cependant, il peut être difficile de passer au crible les options disponibles et les acronymes difficiles à décoder.

Vous avez peut-être remarqué que la plupart des plateformes numériques pour les sciences de la vie sont classées dans la catégorie des systèmes de gestion des informations de laboratoire (LIMS) ou des carnets de laboratoire électroniques (ELN). Sur le papier, ils ont le même son, mais il existe certaines distinctions critiques entre eux. Dans cet article de blog, nous allons explorer les différences entre un ELN et un LIMS, discuter de leurs avantages et fournir de précieux conseils pour vous aider à choisir la solution adaptée à votre laboratoire.

ELN contre LIMS : tout ce que vous devez savoir

Commençons par expliquer ce que sont un ELN et un LIMS et leurs avantages.

Qu'est-ce qu'un ELN ?

Un ELN est une plate-forme logicielle conçue pour enregistrer et gérer les données, les observations, les informations sur les échantillons et les méthodes expérimentales que l'on pourrait gribouiller de façon conventionnelle dans un carnet de laboratoire en papier. Les ELN constituent une excellente solution pour faire face aux pressions réglementaires croissantes visant à préserver l'intégrité et la sécurité des données. De plus, ils vous permettent de collaborer facilement avec les membres de l'équipe, d'enregistrer des observations expérimentales, de les intégrer à des instruments, de créer des rapports détaillés et d'effectuer des recherches à l'aide de simples requêtes par mots clés.

Avantages de l'utilisation d'un ELN

• Possibilité de recherche - Compte tenu de leur nature numérique, les entrées des ELN sont facilement consultables, ce qui leur permet de gagner beaucoup de temps.
• Collaboration facilitée - Les ELN permettent aux laboratoires de partager des données, des notes et des images avec leurs collègues, ce qui en fait une excellente solution pour travailler sur des projets et des expériences en équipe.
• Sécurité - Les ELN permettent les signatures numériques, ce qui permet d'approuver facilement et en toute sécurité les projets et les expériences.
• Traçabilité - Les ELN fournissent une piste d'audit complète de toutes les actions entreprises au sein du système, ce qui permet de suivre facilement qui a fait quoi et quand. Les ELN incluent également la gestion des stocks et des équipements, ce qui facilite le suivi et la gestion des consommables et des équipements de laboratoire.
• Normalisation - Les ELN peuvent inclure un module de protocole, vous permettant de configurer des modèles de travail individuels ou de groupe, ce qui facilite la standardisation des processus et des flux de travail.

Qu'est-ce qu'un LIMS ?

Contrairement à un ELN, le LIMS est un logiciel conçu pour gérer et automatiser les flux de travail et les opérations des laboratoires. Il est idéal pour effectuer des tests répétitifs ou travailler dans le domaine de l'assurance qualité ou laboratoire de biobanques car elle minimise la probabilité d'erreurs humaines. De plus, ils vous permettent de suivre les échantillons (et les métadonnées associées), de joindre des enregistrements d'instruments aux échantillons, de créer des rapports analytiques de base et de gérer les tâches de laboratoire et l'inventaire.

Avantages de l'utilisation d'un LIMS

• Cohérence - Le LIMS peut aider les laboratoires à maintenir la cohérence en suivant de près des flux de travail ou des modèles prédéterminés et en garantissant des résultats précis et reproductibles.
• Normalisation - Les LIMS permettent d'effectuer des tests répétitifs ou de travailler dans les laboratoires de contrôle de la qualité ou d'assurance qualité ou cliniques, car ils sont conçus pour rationaliser les processus et faciliter l'accès aux données essentielles.
• Automatisation - Le LIMS peut aider à automatiser certaines procédures, telles que la génération de rapports, la gestion des échantillons ou suivi de l'inventaire.
• Traçabilité - Le LIMS peut vous aider à suivre facilement les échantillons, les protocoles, les expériences et les résultats, en économisant du temps et des efforts.

Quelles sont les différences entre eLNS et LIMS ?

Bien que l'eLN et le LIMS soient des plateformes logicielles numériques pour la gestion des données de laboratoire, les deux présentent des différences importantes. Les ELN sont conçus pour un grand nombre des mêmes fonctions que les blocs-notes en papier traditionnels, tels que enregistrement de protocoles expérimentaux avec les avantages supplémentaires de la fonctionnalité de recherche, de l'organisation des données et des outils de collaboration. Les fonctions LIMS se concentrent sur la rationalisation des tâches répétitives et des flux de travail à partir de suivi des échantillons à l'analyse des données et à la production de rapports. Ils sont généralement utilisés par les grands laboratoires qui gèrent de nombreux échantillons et données.

Choisir entre un ELN ou un LIMS : quel système vous convient le mieux ?

Maintenant que vous connaissez les principales caractéristiques, avantages et différences entre eLN et LIMS, il est temps de choisir la solution qui vous convient le mieux.

En bref, il est préférable de choisir la solution logicielle qui répond à vos besoins et à ceux de vos laboratoires.

Mais quels sont ces besoins ? La première chose à faire est de rencontrer tous ceux qui utiliseront le logiciel ELN ou LIMS et de mieux comprendre à quoi ils vont l'utiliser. Souhaitez-vous suivre des échantillons provenant de tests de routine et bien définis ? Ou cherchez-vous à organiser les notes, les protocoles et les données des expériences ? Si la collaboration d'équipe est essentielle pour votre organisation, un ELN peut être la solution.

Ensuite, considérez le secteur dans lequel vous travaillez. Par exemple, les sociétés biotechnologiques et pharmaceutiques qui découvrent des médicaments ou effectuent des tests de développement à un stade précoce peuvent trouver dans l'ELN une solution plus appropriée. Dans d'autres environnements de laboratoire, comme Installation de contrôle qualité ou d'assurance qualité, un LIMS peut être mieux adapté à vos tâches.

En outre, tenez compte de l'environnement réglementaire dans lequel évolue votre laboratoire. Si vous travaillez dans un environnement standardisé où le flux de travail est prédéterminé et peu flexible, un LIMS est probablement une meilleure option.

Enfin, les prix des eLN et des LIMS sont très différents. Si le budget vous préoccupe, faites des recherches à l'avance et obtenez un devis précis pour obtenir le meilleur rapport qualité-prix.

ELN ou LIMS : Webinaires

Le webinaire fournira un aperçu des différences entre le LIMS et les eLN, et vous expliquera comment choisir celui qui convient le mieux à votre laboratoire.

https://www.youtube.com/watch?v=dXSXEcmM0g4

Tu apprendras :

• Quelle est la différence entre LIMS et eLNS ?
• Comment choisir celui qui convient le mieux à votre laboratoire ?
• Quels sont les avantages des eLN ?

Finissons-en !

En fin de compte, le choix entre un LIMS et un ELN dépendra largement de ce que vous essayez d'accomplir, de vos principaux besoins en matière de laboratoire, de votre environnement de travail et réglementaire et de votre budget. Comprendre le fonctionnement de chaque système peut considérablement vous aider à prendre une décision. Et en tant que prochaine génération de logiciel de laboratoire numérique holistique et Solutions pilotées par l'IA Si vous entrez sur le marché des sciences de la vie, les problèmes qui peuvent être résolus à l'aide de ces plateformes évolueront et changeront, rationalisant ainsi davantage les opérations des laboratoires.

Si vous souhaitez en savoir plus sur la manière dont les solutions de laboratoire numérique d'eLabNext accélèrent les progrès dans le secteur des sciences de la vie, planifiez une démonstration personnelle dès aujourd'hui.

Des systèmes logiciels tels que LIMS (laboratorium-informatiemanagementsysteem) et ELN (elektronisch labjournaal) verrijken de mogelijkheden om labs te digitaliseren. Die noodzaak wordt breed gevoeld in de labwereld, signaleert Margriet Mestemaker van ElabNext, inhakend op de toegevoegde waarde en actualiteiten als data-integriteit, dataveiligheid en AI ofwel kunstmatige intelligentie.

De mogelijkheden om laboratoria te digitaliseren nemen gestaag toe, met steeds meer functionaliteit in software systemen, aldus Margriet Mestemaker, account manager Benelux chez ElabNext. LIMS et ELN worden beiden voor deze digitalisering gebruikt, al ziet ze wel verschillen. « Un système de gestion des informations de laboratoire est un véritable « outil », destiné à un processus de laboratoire personnalisé avec de nombreuses fonctionnalités et une grande flexibilité. Een elektronisch labjournaal biedt juist veel flexibiliteit en mogelijkheden voor koppelingen met andere systemen, om een passende oplossing te customizen. Dat is volgens mij de toekomst van labdigitalisering. »

Labo dématérialisé

Het « paperless lab » is echter nog geen gemeengoed, volgens Mestemaker. « Iedereen gebruikt een smartphone en heeft geproefd van de digital mogelijkheden. De labsector draait echter op structuur en routine en blijft daarom nog te vaak hangen bij papier. Labs die alles nog op papier doen zie ik niet veel meer, maar de huidige automatiseringsoplossingen zijn vooral hapsnap ingevoerd. Men zoekt nog naar un lieu central où de complete labworkflow digitalaal is georganiseerd. » De labwereld wil dus één oplossing waar alles samenkomt, van inventarisbeheer, analyseplanning en dataverzameling tot kwaliteitscontrole en communicatie over de resultaten.

« De labsector blijft nog te vaak hangen bij papier"

Margriet Mestemaker d'ElabNext

Superposition au LIMS ou à l'ELN

De uitdaging hierbij is dat de overstap naar een ELN- or LIMS system meestal een verandering vergt. « Mais zit dan nog vast aan een bepaalde werkwijze en eigen workflow : 'We deden het altijd zo'. Daarom is het verstandig om met een open blik te kijken hoe men de workflow zo kan aanpassen dat het logisch past bij het nieuwe systeem. Ik zie vaak dat iemand in een trial met een nieuw systeem ervaart dat de bestaande manier van werken toch niet de meest praktische is. »

Signature par un témoin

Natuurlijk is er behoefte om meer labhandelingen te automatiseren, maar zeker zo belangrijk is de compliance : zorgen dat die handelingen volgens de voorschriften worden verricht. Traceability is here het sleutelbegrip, voor procesbeheersing, kwaliteitscontroles en toelatingsprocedures voor bijvoorbeeld een nieuw medicijn. Alles moet worden gelogd en navolgbaar zijn bij audits. Cette question concerne les modèles fixes, les flux de travail structurés et la préservation de l'intégrité des données, aldus Mestemaker. Een digitalaal hulpmiddel waarnaar steeds meer vraag komt is « witness sign » : het zetten van een digital handtekening door een expert of toezichthouder, bijvoorbeeld voor akkoord op een protocol of afsluiting van een experiment, waarmee de data dan zijn vastgelegd. « Dit wordt tegenwoordig voor all aspecten van het labproces gevraagd. Het beperkt bijvoorbeeld de vrijheid om af te wijken van de workflow en maakt datamassage een stuk lastiger. »

LIMS, ELN et sécurité des données

À propos des données parlées : zorgen over dataveiligheid leven breed in de labwereld, weet Mestemaker. Daarom zouden all datacenters voor hosting van LIMS- en ELN-WebApplicaties in de (public or private) cloud gecertificeerd moeten zijn voor informatiebeveiliging volgens ISO 27001. Les utilisateurs peuvent également tout faire dans leur propre maison, sur leurs propres serveurs, mais cela n'a pas de priorité. « Die optie vind ik het minst veilig, omdat gebruikers dan zelf verantwoordelijk zijn voor cybersecurity, backups, enzovoort, terwijl dat niet hun core business is. »

« Een veelbelovende ontwikkeling, maar het heeft nog wel wat jaren nodig voordat het dagelijkse praktijk is »

Margriet Mestemaker d'ElabNext

IA et mégadonnées

Uiteindelijk drait labdigitalisering om data, en dat worden er steeds meer. Kunstmatige intelligentie (IA) komt dan in beeld om uit big data zinvolle informatie te halen. Bijvoorbeeld uit meetresults correlaties tussen parameters afleiden of foto's van celculturen snel analyseren. « Dit is een veelbelovende ontwikkeling, maar het heeft nog wel een aantal jaren nodig voordat het dagelijkse praktijk is op het lab. »

Avantages de la numérisation des laboratoires

Changering kost time, weet Mestemaker, or het nu specifiek on de cloud or AI gaat or om automatisering en digitalisering in brede zin. « C'est une question verte, tout cela est bien parlé par tout conservatisme. Maar als voorlopers met fantastische resultaten komen, zal de rest volgen snel. Beschouw daarom positief-kritisch de workflows op je eigen lab, onderzoek de voordelen van een compleet digitaal labplatform en kijk vooral met een open blik naar labdigitalisering. »

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Plateforme flexible pour ELN

Het gebrek aan automatisering en traceability in hun research lab voor biotechnologie was in 2010 voor twee Groningse onderzoekers aanleiding om eLabNext te starten. Elle a commencé par un logiciel d'inventaire et est devenue une plateforme de numérisation des laboratoires : journal de laboratoire électronique, système de gestion des inventaires et de suivi des échantillons, labprotocolmanager et eLab Marketplace. De marktplaats bevat apps, ook van derden, voor koppeling aan de software van ElabNext om de functionaliteit verder uit te breiden. Dankzij de flexibele opzet is de software van ElabNext ook geschikt voor gebruik buiten de biotech R&D, bijvoorbeeld in een analytisch-chemisch lab. Het bedrijf is wereldwijd actief, telt bijna vijftig medewerkers en is nu onderdeel van laboratoriumleverancier Eppendorf.

Hans van Eerden

En savoir plus sur LabInsights

La durabilité est devenue plus importante que jamais alors que nous sommes de plus en plus déterminés à réduire son impact sur la planète et à inverser le changement climatique. Si nous voulons maintenir notre qualité de vie actuelle, garantir la biodiversité future et protéger la santé de notre écosystème mondial, les dirigeants doivent mettre en œuvre des pratiques plus durables.

Si vous relisez cette phrase, vous remarquerez que la durabilité est centrée sur la protection de la « vie », qu'il s'agisse de la vie des humains ou des millions d'autres espèces avec lesquelles nous partageons la planète. En conséquence, la durabilité est devenue plus essentielle dans un secteur où la vie fait partie du même nom : le secteur des sciences de la vie. Alors que de plus en plus d'entreprises, d'universités et de laboratoires gouvernementaux recrutent des responsables du développement durable et publient des rapports environnementaux, sociaux et de gouvernance (ESG), il est clair que le secteur a fait du développement durable une priorité majeure.

Bien que l'augmentation de la participation mérite d'être saluée, il reste encore un long chemin à parcourir, notamment en ce qui concerne la durabilité des laboratoires. Par exemple, les estimations suggèrent que les laboratoires du monde produisent plus de 5,5 millions de tonnes de déchets plastiques chaque année. L'industrie pharmaceutique mondiale émet 55 % plus de carbone que l'industrie automobile. Entre-temps, 4,4 % des émissions mondiales de gaz à effet de serre sont produits uniquement par le secteur de la santé (hôpitaux et laboratoires, par exemple).

Un changement culturel s'impose dans le secteur des sciences de la vie. Et quel meilleur moment pour en discuter que le Jour de la Terre ?

Grâce à des pratiques et à des équipements de laboratoire plus durables, nous pouvons tous contribuer à un avenir plus sain. Nous verrons comment procéder ci-dessous.

Le changement climatique nous concerne tous

Le changement climatique a déjà un impact sur la santé humaine, sans parler des dommages causés à l'environnement et aux habitats des animaux du monde entier. Les températures plus chaudes entraînent une augmentation des vagues de chaleur, une augmentation des cas de maladies liées à la chaleur, un risque accru de feux de forêt et une recrudescence de la sécheresse. Les tempêtes sont de plus en plus fréquentes, notamment les ouragans et les typhons. La fonte des calottes glaciaires fait monter le niveau de la mer, mettant en danger des millions de personnes.

Les changements climatiques compliquent également la gestion des troupeaux, la chasse et la pêche. Le stress thermique peut limiter les sources d'eau, ce qui entraîne une baisse du rendement des cultures. Alors que nous luttons pour nourrir le monde, nous perdons des espèces 1 000 fois plus rapide plus que jamais dans l'histoire de l'humanité.

Tous ces impacts négatifs sont le résultat direct de l'activité humaine. Nous brûlons des combustibles fossiles pour produire de l'énergie pour les usines de fabrication, les maisons et les transports. Nous utilisons des combustibles fossiles pour produire des plastiques, des appareils électroniques, des matériaux de construction, etc. Nous abattons des forêts pour faire de la place pour les fermes et les pâturages. Tous ces éléments jouent un rôle important dans la production de gaz à effet de serre qui réchauffent notre planète et menacent notre mode de vie et l'avenir de notre planète.

Et à mesure que l'activité et les investissements dans les sciences de la vie s'accéléreront, notre empreinte environnementale collective augmentera en conséquence.

Prioriser la durabilité dans les laboratoires : un appel à l'action

Les entreprises qui prennent des mesures dès maintenant peuvent réduire de manière significative les coûts et les risques futurs tout en augmentant leur valeur. De nombreuses entreprises du secteur des sciences de la vie collaborent déjà avec des organisations gouvernementales et des institutions mondiales qui définiront à terme des réglementations environnementales.

C'est également meilleur pour les résultats financiers. Dans un examen de 200 études sur la durabilité dans le monde de l'entreprise, 88 % ont montré que les bonnes pratiques ESG conduisaient à de meilleures performances opérationnelles. 80 % ont montré une corrélation positive entre la performance des actions et les bonnes pratiques en matière de développement durable.

Une solution numérique pour construire des laboratoires plus durables

De nombreuses entreprises investissent dans des technologies pilotées par les données afin d'améliorer la production, la R&D et la continuité de la chaîne d'approvisionnement. Par exemple, l'IA, les innovations en matière d'automatisation technique et la numérisation globale des laboratoires contribuent à la mise en œuvre de pratiques de laboratoire plus durables. La numérisation peut contribuer à minimiser les pertes de ressources en diminuant le nombre d'expériences répétées inutilement.

De nombreuses sociétés de recherche gaspillent inutilement de l'argent en achetant des réactifs et des matériaux excédentaires ou superflus. Suivi numérique de l'inventaire réduit une grande partie de ce gaspillage en fournissant au personnel du laboratoire une vue constamment mise à jour des stocks actuels, ce qui rend les commandes plus efficaces. Cela met en lumière un problème important : il doit exister une infrastructure numérique adéquate, efficace et préexistante pour que de nombreux laboratoires puissent évoluer dans une direction plus durable.

Le stockage des échantillons dans des congélateurs est l'une des plus grandes consommatrices d'énergie des laboratoires du monde entier. Grâce à la gestion des échantillons, nous pouvons minimiser et gérer le contenu des congélateurs plus efficacement, limitez le nombre de congélateurs nécessaires et réduisez la consommation d'énergie.

La numérisation peut également aider les entreprises à organiser les données désordonnées en informations facilement accessibles et consultables. De même, les entreprises peuvent définir réglementations visant à mesurer la durabilité et à en rendre compte efforts et gestion des déchets, puis fournir des directives à leur personnel existant sur la manière de respecter ces directives. Bien entendu, un financement adéquat est nécessaire pour garantir que les employés puissent investir dans des équipements et des pratiques de laboratoire durables qui seront rentables à long terme.

Le partage est une pratique de laboratoire durable

La collaboration ouverte entre laboratoires et au sein des laboratoires offre une autre excellente opportunité pour réduire l'impact environnemental de la R&D. Le partage d'équipements permet de réduire les charges et d'économiser de l'énergie en supprimant les doublons d'instrumentation qui consomment beaucoup d'énergie et occupent un espace de laboratoire précieux. De plus, le partage réduit la nécessité d'étendre la ventilation des bâtiments et les services publics pour desservir les équipements excédentaires.

En outre, le partage des données peut réduire le nombre d'expériences nécessaires, limiter davantage les besoins en ressources et réduire l'empreinte environnementale de l'industrie des sciences de la vie. La numérisation permet la libre circulation des données entre les collaborateurs. Par exemple, l'utilisation de cahiers de laboratoire électroniques (ELN) simplifie et automatise la documentation des expériences, réduit la main-d'œuvre requise, élimine le besoin de cahiers de laboratoire en papier et facilite le partage d'informations.

Cette pratique nous permet également de réduire l'espace de laboratoire utilisé. La numérisation nous permet d'accéder aux données et de les analyser où que vous soyez. Dans certains cas, moins de membres du personnel peuvent assurer le fonctionnement sûr et efficace de l'ensemble d'un laboratoire. Le plus laboratoires efficaces le devenir, moins nous avons besoin d'énergie et de ressources, et plus ce secteur peut être durable.

La numérisation fait partie d'une solution complète pour la durabilité des laboratoires

Malgré tous les avantages des pratiques numériques durables des laboratoires soulignés ci-dessus, il y a un inconvénient à prendre en compte : le stockage. La révolution du Big Data bat son plein et le stockage des données est essentiel à leur cycle de vie. Dans un monde numérisé, nous dépendrons de serveurs pour stocker ces informations et y accéder. Ces serveurs nécessitent de l'énergie et de la maintenance, ce qui entraîne des émissions de CO₂ émissions.

Nous devons donc étudier et surveiller en permanence les émissions de CO₂ émissions de ces technologies dans les sciences de la vie. Une étude récente a estimé le CO₂ émissions provenant d'une analyse d'association pangénomique (GWAS) à 4,7 kg de CO₂ à 17,3 kg de CO₂, en fonction de la version du logiciel utilisée.

À titre de contexte, une voiture particulière émet environ 14,3 kg de CO₂ pour 100 kilomètres.

Nous pouvons rendre les serveurs plus durables en utilisant les leçons ci-dessus sur le partage et la collaboration. L'utilisation de serveurs centraux, qui sont gérés selon des pratiques plus économes en énergie que les petits serveurs locaux, et l'utilisation d'énergie verte comme source d'alimentation peuvent réduire considérablement l'impact environnemental du stockage des données.

Protéger la planète grâce à des laboratoires durables

La durabilité améliore la qualité de notre vie, protège notre écosystème et préserve les ressources naturelles pour les générations futures. Bien que la numérisation soit un défi, elle recèle un énorme potentiel pour contribuer à la réduction des émissions de CO₂ émissions si nous pouvons les déployer judicieusement.

Alors que de plus en plus de laboratoires se tournent vers des solutions d'inventaire numérique et de gestion des données, le secteur des sciences de la vie peut partager des données, des instruments et des serveurs de manière plus efficace, réduire la consommation d'énergie grâce à l'entreposage frigorifique et garantir des opérations efficaces. Ainsi, nous pouvons créer moins de déchets et produire moins d'émissions de gaz à effet de serre.

Si vous cherchez une voie vers la numérisation en ce Jour de la Terre, eLabNext plateforme de laboratoire numérique peut faciliter le processus. Planifiez votre démonstration aujourd'hui, et nous vous montrerons comment transformer votre laboratoire en une machine de recherche légère et écologique.

Nous sommes heureux de partager un résumé de la table ronde qui a eu lieu lors de l'ouverture de notre nouveau bureau à Glendale, en Californie, le mois dernier. L'événement a été une excellente occasion pour les participants de nouer des contacts avec les différents stands, et nous avons présenté les points forts de chacun d'entre eux afin que vous puissiez les contacter directement.

Nous aimerions prendre un moment pour exprimer notre gratitude à SmartGate VC et Hero House pour leur chaleureuse hospitalité et leur accueil. C'est un honneur de faire partie d'un écosystème d'IA aussi dynamique, et nous sommes ravis d'y apporter notre expertise en biotechnologie. Nous souhaitons également la bienvenue au maire Ardy et au sénateur Portanito, qui se sont joints à nous pour célébrer ce nouveau chapitre passionnant.

Principaux points à retenir

• La révolution de l'IA se produit au moment où vous lisez ces lignes, que cela nous plaise ou non, et ceux qui s'y préparent en bénéficieront énormément. Ceux qui ne le feront pas seront à la traîne, en particulier dans l'industrie biotechnologique et pharmaceutique. Cela est également très étroitement lié aux secteurs universitaire et de la santé.
  • Ressource #1 : Harvard Business Review — « La résolution du problème de l'air ne fait que commencer »
  • Ressource #2 : « 10 étapes pratiques pour utiliser l'IA dans votre laboratoire de recherche »
• Erwin Seinen, fondateur d'eLabNext
  • Le développement de nouvelles technologies ouvre de nouvelles possibilités,
    démontré par ce cas d'utilisation d'efforts de conservation qui incluent le
    possibilité de faire revivre des espèces disparues.
  • L'utilisation de l'analyse des mégadonnées et de l'apprentissage automatique est de plus en plus courante
    un rôle de plus en plus important dans l'avancement de la recherche scientifique.
• Zareh Zurabyan, responsable d'ElabNext, Amériques
  • La clé du succès d'un laboratoire de R&D est de disposer d'un écosystème numérique connecté et d'être prêt pour l'IA. En utilisant des outils numériques capables de s'intégrer les uns aux autres et un système qui organise toutes vos données, vous permet de les classer et de développer des réseaux de neurones profonds à exploiter à l'avenir.
  • La stratégie du laboratoire numérique est essentielle à la réussite d'un laboratoire.
  • Découvrez comment Colossal Biosciences utilise l'IA pour faire revivre des animaux disparus tels que le mamoth laineux et le Dodo.
• Mehdi Saghafi, ingénieur principal des données chez Bayer
  • La mise en œuvre de solutions numériques est très simple ; vous devez adopter une approche très stratégique dès le début, c'est-à-dire avoir des délais et des objectifs très spécifiques de numérisation des données d'échantillons, des données de reporting et des données d'équipement, et les aborder une par une, grâce à une gestion de projet agile. Découvrez « Les obstacles à l'adoption et les moyens de les surmonter ».
  • Disposer d'un écosystème ouvert est nécessaire pour proposer une solution complète et holistique à une grande entreprise comme Bayer. De nombreux scientifiques, de nombreuses opérations et de nombreux outils numériques sont utilisés. Il est essentiel de disposer d'une connexion entre eux pour garantir l'efficacité et limiter les risques de perte de données. En savoir plus.

• Lucy Abgaryan, fondatrice de GrittGene et de ProOneLabs
  • Il y a un passage des générations précédentes aux nouvelles. Il est essentiel de former votre personnel en conséquence aux avantages de la numérisation de votre laboratoire et de l'innovation et de l'adoption précoce des nouvelles technologies, comme l'IA. Si vous êtes un chercheur principal, un technicien de recherche, qui s'apprête à entreprendre une transition numérique, il est essentiel de garantir un programme de formation approprié et de définir une stratégie numérique dès le début pour réussir. En savoir plus sur la façon dont Moderna s'y prend.
• Taylor Chartier, fondateur de Modicus Prime
  • En période de récession mondiale, vous ne pouvez pas vous permettre de ne pas investir dans des technologies économiques qui accéléreront vos recherches. Dotez vos scientifiques d'outils d'IA qui automatiseront leurs flux de travail pour obtenir des résultats reproductibles plus rapidement.
  • Le contrôle de la qualité de vos processus de recherche est tout aussi important que la qualité de votre produit de recherche. Les logiciels d'intelligence artificielle simplifient les processus de laboratoire de routine et les rendent moins sujets aux erreurs, offrant ainsi aux scientifiques une structure et une tranquillité d'esprit lorsqu'ils mènent des expériences qui leur permettent d'économiser du temps et des ressources autrefois gaspillées dans des études de mauvaise qualité.

Profils LinkedIn

• Zareh Zurabyan, directeur d'ElabNext et consultant en IA et biotechnologies
• Erwin Seinen, fondateur d'eLabNext et consultant en matière d'intelligence artificielle et de biotechnologie
• Lucy Abgaryan, fondatrice de GrittGene et Proone Labs
• Mehdi Saghafi, ingénieur principal des données chez Bayer Pharma
• Taylor Chartier, Modicus Prime, PDG et fondateur de Modicus Prime
• Ashot Arzumanyan, fondateur de SmartGateVC, investisseur

Stands en vedette et informations de contact

Informations de contact de l'entrepriseNikon Instrument, Inc.Junya Yoshika, scientifique senior, junya.yoshika@nikon.com
Fumiki Yanagawa, directrice générale, fumiki.yanagawa@nikon.com
Henning Mann, Développement des affaires et partenariats, henning.mann@nikon.comEppendorfLoreline Lee, directrice des ventes, lee.l@eppendorf.comImplen Inc.Austin Brazzle, spécialiste des produits, abrazzle@implen.comInnovations cardiovasculaires d'OhanVahang Ohanyan, Président, vohanyan@ohcvi.comBrinter Inc.Tom Alapaattikoski, PDG, tom.a@brinter.comMicroscapeJohn Francis, directeur technique et cofondateur, john@microscape.xyzBiographie de l'objectifLital Gilad-Shaoulian, PDG et fondateur, lital@purposebio.comModicus PrimeTaylor Chartier, fondateur et PDG, taylor@modicusprime.comAmaros AIBen Toker, cofondateur/directeur technique, ben@amaros.aiOkomeraSidarth Radjou, PDG, sidarth.radjou@okomera.comMetaba A. EyePhilip Sell, PDG, events@metaba.us

Les anticorps sont des composants essentiels de la recherche biomédicale passée, actuelle et future. Ils ont véritablement révolutionné notre compréhension de la biologie et du développement de la médecine moderne. Les anticorps monoclonaux et polyclonaux contribuent à la détection, à l'isolement et à la quantification des protéines et des différents types de cellules, car ils constituent des réactifs essentiels pour les techniques de laboratoire telles que le dosage immunoenzymatique (ELISA), le western blot, l'immunohistochimie (IHC) et la cytométrie en flux.

En tant que réactifs essentiels dans la plupart des laboratoires, leur gestion, leur qualité et leur organisation sont primordiales. Dans le blog suivant, nous vous présenterons les principaux fournisseurs d'anticorps dans le domaine de la R&D biologique, leurs principales applications en recherche et les meilleures pratiques pour gérer une collection d'anticorps.

Voici ce que nous allons aborder :

• Les 10 principaux fournisseurs mondiaux d'anticorps
• Les anticorps les plus populaires
• 3 domaines de recherche où les anticorps sont indispensables
• Meilleures pratiques pour le suivi des bibliothèques d'anticorps
• Meilleures pratiques pour le stockage des bibliothèques d'anticorps
• Conclusion

Les 10 meilleures sociétés d'anticorps

De nombreuses entreprises fournissent des anticorps, mais les « meilleures » sociétés d'anticorps dépendent de quelques facteurs personnels, tels que vos besoins de recherche spécifiques et le budget de vos laboratoires.

Voici dix sociétés qui figurent parmi les fournisseurs d'anticorps les plus importants et les plus connus aux États-Unis :

• Thermo Fisher Scientific (anciennement Life Technologies)
• Abcam
• Biotechnologie de Santa Cruz
• Laboratoires Bio-Rad
• Technologie de signalisation cellulaire
• BD Biosciences
• Systèmes de R&D
• Sigma-Aldrich (qui fait désormais partie de Merck KGaA)
• EMD Millipore (qui fait désormais partie de Merck KGaA)
• Technologies Agilent

Mise en garde : cette liste n'est en aucun cas exhaustive. De nombreuses autres sociétés réputées fournissent des anticorps. Il est important d'évaluer soigneusement la qualité et la spécificité de tous les anticorps avant de les acheter pour des expériences.

Les produits à base d'anticorps les plus populaires

Les anticorps les plus utilisés peuvent varier dans le temps et selon les différents domaines de recherche ou tendances, car la popularité des différentes cibles et applications peut évoluer au fil du temps.

Voici quelques exemples de certains des anticorps les plus couramment utilisés et vendus dans le domaine de la recherche :

• Anticorps anti-GAPDH (glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase) : La GAPDH est une enzyme omniprésente qui joue un rôle clé dans la glycolyse et qui est souvent utilisée comme contrôle de charge dans les expériences de western blot.
• Anticorps anti-bêta-actine : La bêta-actine est une protéine du cytosquelette largement exprimée qui est également souvent utilisée comme contrôle de charge dans les expériences de Western blot.
• Anticorps anti-FLAG tag : La balise FLAG est une petite étiquette peptidique souvent utilisée pour marquer et purifier des protéines recombinantes dans le cadre d'expériences de biologie moléculaire.
• Anticorps anti-GFP (protéine fluorescente verte) : La GFP est une protéine fluorescente largement utilisée comme rapporteur dans les expériences d'imagerie sur cellules vivantes.
• Anticorps anti-CD3 : La CD3 est une protéine de surface cellulaire présente sur les lymphocytes T, et les anticorps dirigés contre le CD3 sont largement utilisés pour étudier la fonction des lymphocytes T dans la recherche en immunologie.
• Anticorps anti-CD4 : La CD4 est une autre protéine de surface cellulaire présente sur les lymphocytes T, et les anticorps dirigés contre le CD4 sont largement utilisés dans la recherche en immunologie pour marquer et étudier divers sous-ensembles de lymphocytes T.

Ces anticorps sont populaires car ils sont largement utilisés dans de nombreux grands domaines de recherche, sont relativement faciles à utiliser et ont été validés par de nombreuses études de recherche. De plus, bon nombre de ces anticorps sont sur le marché depuis longtemps, ils ont donc eu le temps de se faire connaître et de gagner la confiance des chercheurs.

3 domaines de recherche où les applications d'anticorps sont indispensables

Les bibliothèques d'anticorps peuvent être utiles dans divers domaines de recherche, car elles constituent une source immédiate de divers anticorps pouvant être utilisés pour diverses applications d'anticorps.

Voici quelques-unes des meilleures pratiques en matière de suivi et de dénomination des anticorps dans une bibliothèque :

1. Immunologie : L'étude du système immunitaire et de ses fonctions implique souvent l'utilisation d'anticorps pour marquer et isoler différents types de cellules immunitaires, ainsi que pour détecter diverses cytokines, chimiokines et autres molécules immunitaires. Les bibliothèques d'anticorps sont utilisées pour générer et cribler un grand nombre d'anticorps contre différentes cibles, ce qui peut aider à identifier de nouvelles cibles thérapeutiques ou de nouveaux biomarqueurs.
2. Recherche sur le cancer : Les anticorps sont largement utilisés dans la recherche sur le cancer pour détecter et cibler des biomarqueurs spécifiques des cellules tumorales. En particulier, les anticorps monoclonaux qui ciblent des protéines spécifiques à la surface des cellules cancéreuses sont utilisés comme agents thérapeutiques dans plusieurs contextes. Les bibliothèques d'anticorps peuvent aider à identifier de nouvelles cibles protéiques ou à générer et à cribler de nouveaux anticorps monoclonaux pour le traitement du cancer.
3. Neurosciences : Les anticorps sont utilisés dans la recherche en neurosciences pour marquer et détecter des protéines et des structures cellulaires spécifiques du cerveau, telles que les récepteurs des neurotransmetteurs, les canaux ioniques et les synapses. Les collections d'anticorps peuvent être utilisées pour générer et cribler des anticorps contre différentes cibles neuronales, ce qui peut aider à identifier de nouvelles cibles thérapeutiques pour les troubles neurologiques ou améliorer notre compréhension du cerveau et de ses fonctions.

De nombreux autres domaines de recherche, tels que la recherche sur les maladies infectieuses, la biologie végétale et autres, utilisent des collections d'anticorps. Les besoins de recherche spécifiques d'un laboratoire détermineront l'utilité d'une banque d'anticorps sur le terrain ou en laboratoire.

Meilleures pratiques pour le suivi des bibliothèques d'anticorps

Le suivi des anticorps et l'établissement de conventions de dénomination cohérentes pour les collections d'anticorps sont essentiels pour garantir la qualité, la précision et la fiabilité de ces réactifs clés. Si un anticorps est mal étiqueté ou égaré, les résultats expérimentaux pourraient être mal interprétés et le rythme de la recherche pourrait être ralenti.

Voici quelques-unes des meilleures pratiques pour suivre et nommer les anticorps dans une bibliothèque :

1. Attribuez un identifiant unique : Un identifiant unique, tel qu'un chiffre ou une combinaison de lettres et de chiffres, doit être attribué à chaque anticorps de la bibliothèque. Cet identifiant doit être utilisé de manière cohérente dans tous les systèmes de documentation et de suivi.
2. Documentez les informations sur les anticorps : Outre l'identifiant, des informations sur l'anticorps doivent être documentées, telles que l'antigène qu'il cible, l'espèce hôte dans laquelle il a été élevé et l'épitope spécifique qu'il reconnaît.
3. Utilisez un système de suivi : Un système de suivi, tel qu'une base de données électronique ou un système de gestion des informations de laboratoire (LIMS), peut aider à suivre l'emplacement et l'utilisation de chaque anticorps de la bibliothèque.
4. Standardisez les conventions de dénomination : Des conventions de dénomination cohérentes peuvent aider à éviter toute confusion et à garantir l'exactitude. Par exemple, les conventions de dénomination peuvent inclure l'identifiant de l'anticorps, suivi de l'antigène cible, puis de l'espèce hôte, telle que « souris AB1234-CD3 ».
5. Utilisez le code-barres ou la technologie RFID : Code-barres ou Technologie RFID (identification par radiofréquence) peut être utilisé pour suivre et localiser des anticorps individuels dans la bibliothèque. Chaque anticorps peut être étiqueté à l'aide d'un code-barres ou d'une étiquette RFID unique, qui peut être scanné ou lu pour identifier et trouver rapidement l'anticorps.
6. Mettez régulièrement à jour et révisez votre bibliothèque : Il est important de mettre à jour et de revoir régulièrement les conventions de suivi et de dénomination pour s'assurer qu'elles restent précises et efficaces, en particulier lorsque de nouveaux anticorps sont ajoutés à la bibliothèque ou que des expériences sont menées.

Meilleures pratiques pour le stockage des bibliothèques d'anticorps

Le stockage adéquat des anticorps dans des congélateurs est un autre aspect crucial pour maintenir la stabilité et l'activité d'une collection au fil du temps.

Les meilleures pratiques pour la conservation des anticorps dans les congélateurs sont les suivantes :

1. Surveillez la température du congélateur : Utilisez un thermomètre pour contrôler régulièrement la température à l'intérieur du congélateur. Il est recommandé d'utiliser un thermomètre avec une sonde calibrée qui peut être placée à proximité de la zone de stockage des anticorps. La température doit être maintenue à -80 °C pour un stockage à long terme.
2. Utiliser les alarmes du congélateur : Mettez en place un système d'alarme qui alerte le personnel du laboratoire en cas de dysfonctionnement du congélateur ou d'écart de température. De nombreux congélateurs sont équipés d'alarmes intégrées, ou vous pouvez utiliser des alarmes externes connectées au congélateur.
3. Minimisez l'ouverture et la fermeture du congélateur : Minimisez la fréquence et la durée des ouvertures des portes afin de réduire le risque de fluctuations de température. Encouragez le personnel du laboratoire à sortir tout le matériel nécessaire en une seule visite et évitez de laisser la porte du congélateur ouverte pendant de longues périodes.
4. Maintenir l'organisation du congélateur : Assurez-vous que le congélateur est organisé et que la zone de stockage des anticorps est facilement accessible. Utilisez des grilles ou des boîtes de congélation clairement étiquetées et organisées par type d'anticorps ou par expérience afin de faciliter le prélèvement rapide et facile.
5. Utilisez le stockage de sauvegarde : Envisagez d'utiliser un congélateur de secours ou un stockage hors site pour les échantillons d'anticorps critiques afin de vous protéger contre d'éventuels dysfonctionnements du congélateur ou des pannes de courant.
6. Entretien régulier : Effectuez l'entretien et le nettoyage de routine du congélateur pour vous assurer qu'il fonctionne correctement. Nettoyez et décongelez le congélateur si nécessaire, et vérifiez qu'il n'y a pas de signes d'usure, tels que des joints endommagés, qui pourraient affecter ses performances.

Conclusion

La gestion d'une bibliothèque d'anticorps en laboratoire implique le suivi de nombreux réactifs, la garantie de leur qualité et leur organisation pour faciliter leur utilisation. En suivant les meilleures pratiques ci-dessus, vous pouvez vous assurer que votre bibliothèque d'anticorps est correctement stockée et maintenue, ce qui contribuera à garantir la qualité et la fiabilité de vos recherches.

En plus de ces bonnes pratiques, vous pouvez faciliter l'accès à la collection d'anticorps en mettant en œuvre logiciel de gestion d'inventaire de laboratoire, tels que ceux proposés par eLabNext.

Pour en savoir plus sur la façon dont notre plateforme peut permettre une gestion efficiente et efficace de votre collection d'anticorps, contactez-nous pour une démonstration personnelle.

Ramener les espèces perdues nécessitera un effort scientifique novateur et les outils nécessaires pour exploiter de vastes étendues de données génomiques.

La conservation de la faune sauvage s'est traditionnellement concentrée sur la protection des espèces avant leur disparition, mais les progrès de la technologie d'édition du génome soulèvent des questions auparavant inimaginables. Tout d'abord : existe-t-il un moyen de sortir de l'extinction ? Et si c'est le cas, des écosystèmes en difficulté pourraient-ils être « réensauvagés » par des animaux disparus depuis longtemps ?

En 2021, l'entrepreneur Ben Lamm et le généticien de renommée mondiale de Harvard George Church ont fondé Colossal Biosciences avec le projet audacieux de créer des animaux très similaires aux mammouths laineux en utilisant les techniques révolutionnaires de génie génétique de Church. En janvier 2023, Colossal avait attiré 225 millions de dollars de capital-risque et avait élargi sa mission pour inclure le retour du thylacine, communément appelé tigre de Tasmanie, et du dodo.

« Notre objectif est de créer un pipeline scientifique complet pour la désextinction », explique Eriona Hysolli, qui dirige la division de biologie de Colossal et dirige son projet sur les mammouths laineux. « Les gens commencent à comprendre à quel point les technologies génétiques peuvent être précieuses pour la boîte à outils de conservation. »

Des entreprises gigantesques

Le concept de Colossal, décrit publiquement pour la première fois par Church lors d'une conférence TEDx en 2013, consiste à réécrire les gènes du plus proche parent génétique du mammouth, l'éléphant d'Asie, afin d'intégrer des éléments essentiels glanés lors de l'analyse de l'ADN ancien de mammouth : dépôts graisseux, cheveux hirsutes, petites oreilles, biologie circadienne et autres caractéristiques liées à la résistance au froid, par exemple. Les nouvelles espèces hybrides pourraient être réintroduites dans les écosystèmes de la toundra, où les chercheurs pensent que leur forte empreinte améliorerait la pénétration du froid dans le pergélisol pour empêcher sa fonte, tout en favorisant le passage d'un écosystème de toundra à cycle lent à un écosystème de prairies à cycle rapide.

Au départ, les agences de financement se sont montrées peu enthousiastes à l'égard des recherches sur la désextinction menées dans le laboratoire de Church. Une personne intéressée était Hysolli, une experte en cellules souches qui a rejoint le laboratoire en 2015 en tant que post-doctorant.

« À l'époque, je lisais Neanderthal Man de Svante Pääbo et j'étais fascinée par le parcours qu'il fallait parcourir pour séquencer l'ADN ancien », se souvient-elle. « George est mentionné dans ce livre parce qu'il réfléchissait au-delà du simple séquençage d'une espèce, mais aussi à la manière dont son retour peut restaurer tout un écosystème. »

Après des succès tels que l'amélioration de l'édition multiplex de bases de cellules de mammifères, une technique qui utilise des enzymes modifiées, telles que les systèmes CRISPR-Cas, pour recoder simultanément plusieurs parties d'un génome, Hysolli a saisi l'opportunité de rejoindre Colossal en tant que premier biologiste.

« Nous menons des recherches révolutionnaires et nos flux de travail sont tout à fait uniques, ce qui fait que nous avons toujours l'impression d'être dans un laboratoire », déclare-t-elle. « La désextinction englobe de nombreux domaines dans lesquels vous devez développer une expertise et de nouvelles technologies. Colossal a donc toujours cette sensation de recherche fondamentale. »

Déplacez-vous vite et (ne) cassez aucun objet

Immédiatement après avoir rejoint la start-up, Hysolli a dû relever le défi de constituer une équipe et de développer des protocoles pour le projet sur le mammouth laineux. Alors qu'elle était habituée aux méthodes traditionnelles de tenue de dossiers à la plume et au papier dans le laboratoire de l'Église, cette nouvelle entreprise nécessitait une approche numérique.

« Si vous voulez constituer rapidement une équipe, vous devez être en mesure de partager des données expérimentales immédiatement », explique Hysolli. « L'une des premières choses que nous avons faites a été de nous associer à un fournisseur de cahiers de laboratoire électroniques. Cela permet la circulation des connaissances, non seulement au sein de mon équipe, mais aussi entre les équipes. Il est facile de regarder l'expérience et de télécharger le résultat. »

Avec plusieurs génomes presque complets du mammouth laineux séquencés en 2015 et 2021, Hysolli et ses collègues se sont concentrés en grande partie sur l'analyse des mégadonnées de l'éléphant d'Asie. En juillet 2022, Colossal et le Vertebrate Genomes Project ont annoncé avoir séquencé et assemblé avec succès le génome de l'éléphant d'Asie au niveau du génome de référence, le premier du genre pour les éléphants.

« Les laboratoires créent des lacs de données », explique Zareh Zurabyan, spécialiste de la stratégie numérique des laboratoires et responsable d'eLabNext America, dont la technologie gère les données et les flux de travail de Colossal. « Il existe d'innombrables ensembles de données provenant de multiples instruments, expériences, de nombreuses formes de pièces jointes et d'échantillons contenant des milliers de champs de métadonnées. Il s'agit de l'écosystème idéal pour utiliser l'apprentissage automatique, l'apprentissage profond et l'IA, non seulement pour une analyse approfondie des données, mais aussi pour définir la recherche et la stratégie commerciale de l'entreprise, ce qui vous permet de recentrer le travail en temps réel. »

Erwin Seinen, cofondateur d'eLabNext, constate une tendance vers des entreprises multidisciplinaires qui associent harmonieusement des techniques d'IA et de ML de pointe au travail traditionnel en laboratoire humide. « Cette approche est en train de devenir la norme pour les startups biotechnologiques comme pour les entreprises établies », déclare-t-il. « Colossal illustre la synergie entre ces deux domaines. Il en résultera une nouvelle ère de découvertes scientifiques, où la puissance de l'apprentissage automatique et de l'analyse des données sera exploitée pour stimuler l'innovation dans les sciences de la vie. »

La forme suit la fonction

Hysolli note que la proposition de valeur pour les investisseurs de Colossal ne réside pas seulement dans la désextinction, mais dans le développement plus large de nouveaux outils pour les biologistes, allant de l'ingénierie cellulaire à la reprogrammation en passant par la technologie gestationnelle. « Nous repoussons réellement les limites de la biologie des mammifères, des marsupiaux et des oiseaux, et ces technologies vont au-delà de la désextinction », affirme-t-elle.

En septembre 2022, Colossal a annoncé sa première spin-off, une plateforme de biologie computationnelle appelée Form Bio, que l'entreprise a développée pour gérer ses pipelines de désextinction. Avec 30 millions de dollars de capital-risque, la nouvelle société de logiciels indépendante vise à remplacer les processus encombrants et riches en code par une interface accessible permettant aux scientifiques de réaliser facilement des opérations bioinformatiques.

« Form Bio effectue des analyses génomiques personnalisées pour nous, en particulier en ce qui concerne les relations entre l'ADN et les caractères », explique Hysolli. « Il s'agit de notre ancienne base de données ADN. Nous l'utilisons également pour la puissance informatique et le stockage, et si nous voulons effectuer nos propres analyses, de nombreux flux de travail disposent de fonctionnalités d'IA intégrées.

« Les résultats de nos données étant centralisés via la plateforme eLabNEXT, ils sont facilement accessibles par les équipes d'IA et d'apprentissage automatique. Nous générons tellement de données, et tout cela représente un potentiel inexploité. »

Protégez et préservez

Hysolli souligne le travail continu de Colossal pour faire avancer les efforts de conservation des éléphants, notamment le développement de nouveaux traitements et d'un vaccin pour prévenir le virus de l'herpès endothéliotropique des éléphants. Il prévoit également de construire des génomes de référence de l'éléphant de savane et de l'éléphant de forêt d'Afrique.

« Et si ces éléphants disparaissaient en quelques années, mais que vous n'aviez pas commencé à mettre au point les technologies d'embryologie et de procréation assistée nécessaires à leur retour, les mêmes outils nécessaires à notre travail de désextinction ? » demande Hysolli. « Nous disposons des outils nécessaires pour créer de la biodiversité dans une boîte, mais avec encore plus d'échantillons séquencés et préservés, vous pouvez restaurer des populations entières plutôt que des individus. »

Rester ouvert au public sur les objectifs — et les données — de la désextinction est essentiel pour les perspectives de Colossal, souligne Hysolli.

« Nous essayons d'adapter nos flux de travail pour permettre facilement la préservation des espèces », déclare-t-elle. « Nous nous engageons à restaurer notre patrimoine naturel et à collaborer avec les parties prenantes, car lorsque vous créez des modèles pour réensauvager des écosystèmes, cela doit être fait de manière transparente et éthique. »

Lisez sur Nature

L'industrie biotechnologique a connu une transformation importante ces dernières années, la numérisation étant devenue un outil essentiel pour rationaliser le processus de R&D. Les méthodes manuelles traditionnelles de suivi, de gestion et d'analyse des données et des informations sont de plus en plus obsolètes, et les laboratoires doivent s'adapter pour être compétitifs dans l'environnement rapide et concurrentiel d'aujourd'hui.

Le blog ci-dessous donne un aperçu de l'ampleur de la numérisation dans le secteur des biotechnologies, de ses avantages et de la manière dont les pôles des sciences de la vie de la côte ouest, en particulier du sud de la Californie, mènent la course.

L'ère actuelle de la numérisation dans la R&D en biotechnologie

La technologie numérique a imprégné tous les aspects du pipeline biotechnologique, qu'il s'agisse de découvrir des informations fondamentales pendant la R&D ou d'optimiser les opérations de fabrication et de logistique. Compte tenu des défis actuels auxquels sont confrontées les entreprises du secteur (marché concurrentiel, exigences réglementaires complexes et coûts de recherche élevés), la numérisation n'est plus une « bonne idée ». C'est nécessaire à la survie et à l'innovation continue.

Alors, à quoi ressemble exactement la numérisation pour les entreprises de biotechnologie modernes ?

Quelle que soit la taille de votre entreprise, les discussions sur l'intelligence artificielle (IA) et l'apprentissage automatique (ML) ont probablement suscité votre intérêt. Des nouvelles concernant le travail de AlphaFold et Méta-IA a fait irruption dans le courant en fournissant une solution prometteuse au repliement des protéines, ouvrant ainsi une multitude de voies de R&D aux entreprises de biologie synthétique et de biopharmacie.

D'autres solutions numériques biotechnologiques sont nées de la capacité de la biologie à générer des « mégadonnées » grâce au séquençage de nouvelle génération (NGS) et à d'autres technologies. Pour gérer, analyser et visualiser le volume considérable de données NGS, des approches informatiques pour nettoyer les données de séquençage brutes, aligner les lectures sur un génome de référence, détecter et appeler des variants et effectuer des analyses en aval telles que l'annotation fonctionnelle, l'analyse des voies et les tests statistiques sont devenues une nécessité.

En outre, des solutions basées sur l'IA et le ML ont récemment été déployées pour identifier des modèles et faire des prévisions à partir des vastes données publiques disponibles. Jusqu'à récemment, ces outils et pipelines bioinformatiques n'étaient accessibles qu'aux personnes possédant des compétences informatiques. Cependant, cette tendance s'est récemment inversée et ces analyses sophistiquées sont en train d'être démocratisées grâce à des interfaces faciles à utiliser, une expérience utilisateur simple et aucune expérience de codage n'est requise.

Des initiatives telles que Gène Cellule X, publié en tant qu'outil logiciel open source permettant aux biologistes d'accéder facilement à leurs données de séquençage d'ARN unicellulaire et de les analyser, en sont un parfait exemple. Des entreprises, telles que Bio du formulaire, ont franchi une nouvelle étape en lançant une plateforme commerciale qui met la puissance des flux de travail bioinformatiques entre les mains des biologistes des laboratoires humides et des développeurs de thérapies cellulaires et géniques.

Avantages de la transformation numérique pour la recherche en sciences de la vie et en biotechnologie

Les exemples ci-dessus présentent un avantage clair et direct de la plus haute importance pour la R&D en biotechnologie : des informations sans précédent qui ne seraient tout simplement pas disponibles si les outils numériques n'étaient pas utilisés.

Mais ces outils offrent également des avantages supplémentaires. De nombreuses plateformes informatiques offrent une efficacité accrue, une collaboration et une communication améliorées, la sécurité des données et la protection de la propriété intellectuelle grâce à leur utilisation dans l'espace numérique.

Carnets de laboratoire électroniques (eLN) sont un autre exemple typique. Leur capacité à suivre les expériences, à enregistrer les résultats et à gérer les données sur une plateforme centralisée constitue un avantage significatif pour le personnel de R&D en biotechnologie : ils améliorent la précision et l'intégrité des données tout en économisant du temps et en réduisant les erreurs. L'automatisation des tâches répétitives permet également aux scientifiques de consacrer un temps précieux à des tâches de plus haut niveau, telles que la planification stratégique et le développement commercial.

La numérisation ne fait pas de discrimination : comment le numérique change la scène des start-up biotechnologiques

Les avantages de la numérisation ne se limitent pas aux entreprises internationales. Ils peuvent également être appréciés par ceux qui sont en mode démarrage. L'optimisation des processus, l'amélioration de la collaboration, l'amélioration de l'intégrité et de la sécurité des données et de puissantes informations basées sur l'IA présentent un avantage supplémentaire : l'intérêt des investisseurs potentiels.

La Californie possède depuis longtemps écosystème biotechnologique florissant, attirant les meilleurs talents, des investisseurs tournés vers l'avenir et des startups en plein essor. La région de la baie de San Francisco, en particulier le sud de San Francisco, est devenue un pôle biotechnologique central, avec une forte concentration d'entreprises spécialisées dans la génomique, la médecine personnalisée et la découverte de médicaments. San Diego est également un centre biotechnologique en plein essor, qui se concentre sur les produits biopharmaceutiques, les dispositifs médicaux et les diagnostics. La majeure partie de l'industrie des sciences de la vie en Californie se concentre sur la R&D, afin de rendre l'environnement robuste et agile, et se concentre sur les dernières technologies pour stimuler l'innovation.

Los Angeles a connu une croissance significative dans l'industrie biotechnologique, en particulier dans les domaines de la biotechnologie, de la santé numérique et des technologies médicales. Le comté de Los Angeles a stimulé la croissance du secteur à plus de 195 000 emplois, à près de 3 000 entreprises du secteur des sciences de la vie et à 44,2 milliards de dollars d'activité économique grâce à d'importants investissements dans le développement de la main-d'œuvre, les sociétés de capital-risque et les pôles d'innovation.

HeroHouse : soutenir les startups à la croisée de l'IA et de la biotechnologie

Maison des héros, fondé par SmartGate VC, est l'un de ces pôles qui se concentre sur l'investissement à l'intersection de l'IA, de la santé et de la biotechnologie. Situé à Glendale, en Californie, l'espace relie la science, la technologie, l'entrepreneuriat et le capital et fournit divers services qui soutiennent les startups utilisant l'IA pour résoudre des problèmes biologiques complexes.

L'importance des hubs Hero House pour l'innovation biotechnologique est soulignée par l'ajout récent de ELAB Suivant, une plateforme de laboratoire numérique pour les laboratoires de R&D en sciences de la vie, qui a ouvert un nouveau bureau. En tant que division d'Eppendorf, ElabNext sera en mesure de tirer parti de l'intense scène biotechnologique de la ville et des technologies émergentes pour accélérer la numérisation des acteurs industriels émergents de Los Angeles.

Conclusion

La transformation numérique de l'industrie biotechnologique a révolutionné le secteur, la numérisation étant un outil essentiel pour rationaliser la R&D. Les nombreux avantages du « passage au numérique » ont contribué à la croissance des pôles des sciences de la vie sur la côte ouest, en particulier dans les zones émergentes comme Los Angeles. À mesure que nous progressons, il est clair que la numérisation continuera d'être un moteur de la recherche en biotechnologie.

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