L'utilisation d'eLabNEXT a considérablement amélioré la capacité de mon laboratoire à gérer des expériences individuelles liées à chaque projet mené dans le laboratoire. En outre, nous disposons d'une gestion et d'une traçabilité des données nettement améliorées maintenant que nous sommes entièrement intégrés à la plateforme eLabNext.

Diego Diel, DVM, MS, Ph.D., professeur agrégé de virologie au département de médecine des populations et des sciences diagnostiques de la faculté de médecine vétérinaire de l'université Cornell

Le laboratoire Diel de la faculté de médecine vétérinaire de l'université Cornell

Créé en 2014, le Laboratoire Diel est dirigé par Diego Diel, DVM, MS, Ph.D., et vise à comprendre les mécanismes moléculaires qui sous-tendent l'infection par les virus à ADN et à ARN, l'immunité et la pathogenèse d'un hôte. L'objectif à long terme du laboratoire est d'utiliser cette recherche fondamentale pour développer de nouveaux vaccins et de nouvelles plateformes vaccinales pour les humains et les animaux. Ils se concentrent également sur le développement de diagnostics de nouvelle génération pour la détection, l'identification et la caractérisation des virus.

Entre 2014 et 2019, le laboratoire Diel a fonctionné dans le cadre du département des sciences vétérinaires et biomédicales et des laboratoires de recherche Oscar E. Olson de la South Dakota State University. En 2019, le laboratoire Diel a été transféré au département de médecine des populations et des sciences diagnostiques de la faculté de médecine vétérinaire de l'université Cornell, où il opère actuellement. Il emploie une équipe talentueuse de 10 scientifiques et doctorants possédant une vaste expertise en virologie fondamentale et moléculaire.

Le laboratoire Diel étudie actuellement comment les picornavirus et les coronavirus (y compris le SARS-CoV-2) échappent à la détection par le système immunitaire inné. Pendant la pandémie de COVID-19, le laboratoire a commencé à étudier le large éventail d'hôtes du virus SARS-CoV-2 et a découvert que le virus infecte cerf de Virginie ainsi que tigres et lions hébergés au zoo du Bronx et peuvent servir de réservoirs pour les variants préoccupants. Enfin, le laboratoire étudie les effets des modifications génétiques sur la pathogenèse virale, la dynamique des infections et le tropisme tissulaire.

Objectifs

À court terme: À court terme, le laboratoire Diel cherche à mieux comprendre les mécanismes moléculaires qui sous-tendent l'infection par les virus à ADN et à ARN, l'immunité et la pathogenèse d'un hôte.

À long terme : L'objectif à long terme du laboratoire Diel est de développer de nouveaux vaccins et de nouvelles plateformes vaccinales pour les humains et les animaux. Ils se concentrent également sur le développement de diagnostics de nouvelle génération pour la détection, l'identification et la caractérisation des virus.

Difficultés 

Pour mieux inventorier les échantillons et les réactifs

La gestion et l'organisation de l'inventaire de manière claire et précise dans un laboratoire d'étudiants et de scientifiques constituent un défi. En particulier, la coordination du suivi et du réapprovisionnement des échantillons et des réactifs nécessite un processus robuste pour éviter les pénuries ou les expirations de réactifs, ainsi que la perte ou le mauvais placement des échantillons. Une communication, une adhésion et une formation efficaces pour établir des protocoles d'inventaire sont essentielles au maintien de l'intégrité et de l'efficacité des recherches et des expériences en cours.

Pour documenter de manière précise et cohérente les expériences, les enregistrements et les données

La documentation précise et cohérente des expériences, des enregistrements et des données dans un laboratoire de virologie avec une grande équipe peut s'avérer problématique en cas de variations dans les pratiques de documentation et d'interprétation des données. Il est essentiel de maintenir des SOP uniformes pour l'enregistrement, le stockage et l'analyse des données afin de garantir la cohérence et d'éviter les erreurs ou les incohérences. Une formation régulière et des mesures de contrôle de la qualité sont essentielles pour atténuer ces défis et préserver l'intégrité des résultats de la recherche.

Le laboratoire Diel recherchait une solution facile à utiliser et rentable qui pourrait être mise en œuvre par tous les membres de l'équipe du laboratoire afin de garantir la gestion de toutes les données, échantillons et réactifs critiques afin que les objectifs du laboratoire puissent être atteints à court et à long terme.

Solution

eLabNext améliore la collaboration et l'organisation institutionnelles

Pour relever les défis ci-dessus, le Diel Lab a recherché des options de numérisation des laboratoires en ligne et a trouvé le site Web eLabNext. La plateforme eLabNEXT a été initialement créée dans le laboratoire de virologie de Centre de diagnostic zoosanitaire de Cornell. Après une mise en œuvre réussie, le logiciel a été transféré au laboratoire Diel.

Plus précisément, le laboratoire a utilisé eLabInventory pour établir des flux de travail d'inventaire, d'échantillonnage et de suivi des échantillons. Le logiciel de gestion des stocks du laboratoire s'intègre à eLabNext, qui a également été mis en œuvre par le laboratoire Diel sous la forme d'un carnet de laboratoire électronique tout-en-un, supprimant ainsi la dépendance du laboratoire à l'égard des cahiers de laboratoire en papier et le temps associé à la recherche manuelle de données et de dossiers expérimentaux. Sans le logiciel eLabNext, le laboratoire Diel aurait peut-être supprimé par inadvertance des échantillons critiques et géré les données de manière incorrecte, entraînant leur perte.

Le Diel Lab étant impliqué dans des collaborations internes et externes, l'utilisation de la plateforme eLabNEXT présente un avantage supplémentaire : elle permet de partager facilement des données et des détails expérimentaux entre plusieurs utilisateurs. Cela permet au laboratoire de s'engager efficacement dans des collaborations et des partenariats multi-institutions avec des canaux de communication ouverts et un partage de données.

En outre, eLabNext permet de gérer plusieurs organisations de projets en classant les expériences et les entrées dans des dossiers distincts. La structure améliorée permet des opérations de laboratoire plus efficaces et productives.

Résultats

eLabNext permet un inventaire des échantillons et une gestion des données plus précis

Un an plus tard, la plateforme eLabNEXT fait partie intégrante des opérations quotidiennes du Diel Lab. Ce temps a été nécessaire pour inventorier minutieusement les données, les réactifs et les échantillons du laboratoire et les importer dans le logiciel. L'effort en valait la peine. Le laboratoire bénéficie désormais d'un fonctionnement plus efficace grâce à un inventaire des échantillons plus précis et à une meilleure traçabilité des réactifs, des expériences, des SOP et des données générées par chaque expérience.

La mise en œuvre d'une plate-forme logicielle spécialisée a considérablement amélioré l'efficacité de nos processus de stockage et de prélèvement d'échantillons. Ce logiciel fournit un système centralisé et numérisé qui catalogue et suit méticuleusement chaque échantillon, rationalisant ainsi l'organisation de notre vaste inventaire d'échantillons. Il a considérablement réduit le temps et les efforts consacrés auparavant à la tenue manuelle des dossiers et à la recherche dans les archives physiques. De plus, les fonctionnalités de recherche et de récupération robustes de la plateforme ont permis au laboratoire Diel de localiser avec précision l'emplacement des échantillons en quelques secondes, garantissant ainsi un accès plus rapide aux expériences et à la recherche et, en fin de compte, améliorant la productivité globale et la précision du laboratoire dans la gestion des échantillons.

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