« Cela a toujours été un réel plaisir de collaborer avec l'équipe d'eLabNext. Leur personnel est toujours très attentif et disponible pour nous soutenir dans nos demandes, prendre note de nos demandes d'évolution et nous faire part de vos commentaires. C'est comme si nous faisions tous partie de la même équipe et que nous travaillions ensemble pour mener à bien le projet. »

Équipe eLabNext de l'Institut Pasteur, département informatique

À propos de l'Institut Pasteur

Fondé en 1887 et basé à Paris, en France, l'Institut Pasteur est un institut international de recherche et d'enseignement dédié à l'avancement de la science, de la médecine et de la santé publique. En tant que fondation privée à but non lucratif reconnue d'utilité publique, l'Institut Pasteur s'engage dans quatre missions principales d'intérêt public : la recherche, l'éducation, la santé de la population, le développement de l'innovation et le transfert de technologie.

Objectifs

À court terme : Les besoins stratégiques de l'Institut Pasteur étaient de relever les défis d'efficacité des laboratoires liés à la numérisation de toutes les données de recherche et d'améliorer la collaboration entre les unités de recherche internes et les partenaires externes.

À long terme : À l'avenir, l'Institut Pasteur cherche à optimiser en permanence ses flux de recherche afin de répondre aux demandes scientifiques croissantes.

Difficultés

Dans les 12 départements de recherche de l'Institut Pasteur, les méthodes traditionnelles de gestion de la documentation et des échantillons de recherche présentaient d'importants domaines d'amélioration pour accroître l'efficacité des laboratoires. Chaque unité de recherche avait développé sa propre approche de la gestion des laboratoires, en s'appuyant souvent sur des systèmes papier et des outils numériques disparates. Ce manque de standardisation a entraîné un risque de perte de travail de recherche, les chercheurs consacrant beaucoup de temps à des tâches administratives telles que la localisation des échantillons, le suivi des données et l'organisation des dossiers expérimentaux. Les approches variées de la gestion des données ont rendu difficile la collaboration au sein de l'unité et le partage efficace des informations de recherche.

À mesure que les activités de recherche de l'organisation gagnaient en ampleur et en complexité, ces défis se sont accentués.

Transformez la gestion des données de votre laboratoire avec eLabNext

Solution

L'Institut Pasteur a décidé de mettre en place un outil dédié, un carnet de laboratoire électronique et un système de gestion des échantillons, dans toutes les unités de recherche de l'institut. L'équipe a découvert eLabNext à la suite de discussions avec d'autres instituts et de recherches en ligne. Ils ont décidé d'adopter ELABnext après avoir évalué plus de 20 carnets de laboratoire électroniques (ELN) et solutions de suivi des échantillons différents. Cette décision a été motivée par les fonctionnalités, la facilité d'utilisation et la rentabilité de la plateforme Digital Lab d'eLabNext. Les aspects juridiques et de sécurité des données étaient essentiels pour l'Institut Pasteur. Les scientifiques participant à la première phase d'évaluation de l'appel d'offres ont comparé sept solutions, pour finalement en réduire le nombre à deux, dont eLabNext, pour la preuve de concept (POC).

Le choix final a été fait par des scientifiques d'une cinquantaine d'unités différentes, en tenant compte à la fois de leurs propres besoins et, surtout, de ceux de leurs collègues travaillant dans divers domaines de recherche.

Pour faciliter la mise en œuvre de la nouvelle plateforme de laboratoire numérique, une équipe dédiée, qui était également en charge de l'appel d'offres et du POC, a été créée au sein du service informatique. Cette équipe a contribué à intégrer la technologie au personnel et aux installations de toutes les unités de recherche de l'Institut Pasteur et des instituts étrangers.

Le processus de mise en œuvre a été organisé en quatre vagues de déploiement, la plate-forme de laboratoire numérique d'ElabNext étant présentée étape par étape de manière structurée. Cela comprenait des présentations initiales, des réunions de suivi, des réunions d'évaluation, des ateliers et des sessions de formation mensuelles pour les membres existants et les nouveaux membres de l'équipe.

Résultats

La mise en œuvre de la plateforme de laboratoire numérique d'eLabNEXT a permis de rationaliser la façon dont les laboratoires travaillent à l'Institut Pasteur. Grâce à des fonctionnalités améliorées d'organisation des données, l'enregistrement, le suivi et la documentation des activités de recherche sont devenus plus rationalisés et transparents. Le module d'équipement s'est également révélé très utile, car il a permis de centraliser les informations relatives à l'équipement et d'organiser les réservations des équipes. Le fait de disposer d'un centre centralisé pour les données de recherche a permis au personnel de collaborer plus facilement et plus efficacement, ce qui est devenu une exigence en constante évolution de la recherche. La plateforme a facilité le partage d'expériences et la collaboration au sein du laboratoire. Les chercheurs peuvent désormais télécharger, générer et associer des protocoles et des procédures opérationnelles standard (SOP) à des expériences spécifiques. Cela inclut le lien entre les échantillons et les expériences, ce qui rationalise les processus et améliore la collaboration au sein de l'équipe. Tout étant connecté (protocoles, expériences et échantillons), le laboratoire bénéficie d'une traçabilité complète, ce qui permet de voir facilement ce qui a été fait et par qui. Le système fournit également des fonctionnalités de sauvegarde robustes, garantissant que toutes les données sont stockées et accessibles en toute sécurité. En conséquence, l'environnement de recherche est devenu plus transparent et intégré, où la collaboration et le partage de données sont au cœur des opérations quotidiennes.

Plans pour l'avenir

L'Institut Pasteur a l'intention de continuer à tirer parti de la plateforme de laboratoire numérique eLabNext pour garantir la durabilité et l'accessibilité de la recherche. Alors que les activités de recherche continuent de se développer, les unités de recherche s'attendent à ce qu'eLabNEXT renforce sa capacité à partager les résultats expérimentaux, à améliorer la communication et à favoriser les découvertes. À l'avenir, l'institut espère également intégrer eLabNext aux flux de travail automatisés des laboratoires, ce qui lui permettra de faire progresser les opérations des laboratoires de manière optimisée.

Perspectives de l'unité des mécanismes du cycle cellulaire bactérien

« eLabNext a changé la donne pour notre laboratoire de l'Institut Pasteur. Son interface intuitive et ses fonctionnalités de suivi robustes ont rationalisé notre gestion des échantillons, transformant ce qui était autrefois une tâche fastidieuse en un processus rapide et facile. Je suis très impressionné par la façon dont eLabNext a transformé nos opérations quotidiennes et je le recommande vivement à tout laboratoire confronté à des défis similaires. »

Mariano Martinez, ingénieur de recherche et responsable de laboratoire, Unité des mécanismes du cycle cellulaire bactérien, Institut Pasteur

Notre laboratoire Mécanismes du cycle cellulaire bactérien est composé de neuf membres et notre objectif de recherche central est de comprendre les mécanismes du cycle cellulaire chez les Corynebacteriales, un groupe de bactéries qui comprend des agents pathogènes humains majeurs tels que Mycobacterium tuberculosis ou Corynebacterium diphtheriae. Nous utilisons une approche de biologie cellulaire mécaniste pour comprendre comment fonctionnent les mécanismes de division et d'élongation et comment ils sont régulés dans le temps et dans l'espace. Nous voulons obtenir des informations structurales directes sur l'architecture globale du divisome ou de ses sous-complexes ; un objectif de longue date de la communauté de la division cellulaire qui reste extrêmement difficile en raison de sa taille, de sa complexité, de sa localisation membranaire et de sa nature hautement dynamique.

Objectifs

À court terme : L'unité des mécanismes du cycle cellulaire bactérien gère un large éventail d'échantillons divers, d'où l'importance d'un processus efficace de gestion et de prélèvement des échantillons. Pour soutenir cette évolution, l'équipe met en œuvre un processus de recherche et de restauration plus rationalisé. L'amélioration de l'organisation et de l'accessibilité des dossiers de recherche est également une priorité, en veillant à ce que l'information soit facilement accessible à tous les membres de l'équipe.

À long terme : en se concentrant sur la numérisation des pratiques de recherche, l'unité vise à continuer à apporter une contribution précieuse à la communauté scientifique et au-delà.

Difficultés

Avant d'adopter la plateforme de laboratoire numérique d'eLabNEXT, les laboratoires de l'unité des mécanismes du cycle cellulaire bactérien s'appuyaient sur des cahiers en papier traditionnels pour documenter les plans, les protocoles et les résultats expérimentaux. Les données de recherche étaient dispersées dans différents silos et emplacements, y compris dans un mélange d'ordinateurs personnels, de disques externes et de stockage dans le cloud.

L'approche précédente de génération et de stockage des données rendait parfois fastidieuse la récupération d'informations spécifiques. Cela était particulièrement pertinent lorsque le personnel faisait la transition entre les laboratoires ou changeait de rôle. Reconnaissant les possibilités d'amélioration, l'unité visait à mettre en œuvre un système centralisé et efficace facilitant l'accès aux expériences et aux échantillons. En numérisant les pratiques de recherche, l'équipe a veillé à ce que les données soient accessibles de n'importe où, améliorant ainsi la continuité et l'intégrité de la recherche.

Solution

eLabNext a fourni une solution adaptée aux besoins spécifiques de chaque laboratoire, tout en s'alignant sur la transition mondiale vers la numérisation et la nécessité d'un partage des données et d'une collaboration fluides. Cette nouvelle approche permet aux membres de l'équipe de trouver et de partager facilement des données à la fois au sein du laboratoire et entre les unités de recherche, garantissant ainsi l'accessibilité de n'importe où, même en dehors du cadre de l'Institut Pasteur. Par conséquent, la numérisation des données a non seulement garanti la longévité des informations critiques, mais a également optimisé les flux de travail et accru l'efficacité des laboratoires.

Résultats

Depuis l'adoption d'eLabNext, l'unité des mécanismes du cycle cellulaire bactérien a connu une transformation dans sa façon de gérer les données de recherche et les échantillons. La plate-forme numérique centralisée du laboratoire a considérablement amélioré l'organisation et l'accessibilité des dossiers de recherche, permettant aux chercheurs de documenter et de récupérer plus facilement les données expérimentales. Cette nouvelle approche a transformé la façon dont l'équipe travaille, garantissant que les données sont toujours accessibles aux scientifiques et à l'ensemble de l'équipe.

L'unité a également remarqué une amélioration significative du suivi et de la récupération des échantillons grâce à la fonction avancée de navigateur d'inventaire d'ElabNext. Il offre un aperçu complet du stockage des échantillons, de leur utilisation et de toutes les données connexes issues d'expériences précédentes, ce qui en fait un outil précieux pour gérer le nombre important et diversifié d'échantillons traités par l'unité des mécanismes du cycle cellulaire bactérien dans le cadre de divers projets de recherche. La puissante intégration entre l'inventaire du laboratoire et la plateforme numérique centralisée du laboratoire facilite le suivi des échantillons jusqu'aux résultats, rationalisant ainsi les opérations quotidiennes.

Plans pour l'avenir

À l'avenir, l'unité Mécanismes du cycle cellulaire bactérien de l'Institut Pasteur prévoit de continuer à tirer parti d'eLabNext pour renforcer ses capacités de recherche. Alors que l'unité continue d'étendre ses efforts de recherche, elle explore la possibilité d'intégrer des outils et des modules complémentaires eLabNEXT supplémentaires pour répondre à des besoins de recherche plus avancés.

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