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Worauf Sie bei einer Probenverwaltungsplattform achten sollten

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Zareh Zurabyan
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In biologischen und chemischen Forschungs- und Entwicklungslabors kann der Begriff „Probenmanagement“ viele verschiedene Bedeutungen haben.

Eine „Probe“ könnte eine lebende Maus in einer großen Kolonie sein.

Oder eine Zelllinie in einer Kryoröhre, die sich in ihrer 20. Passage befindet.

Oder eine neu synthetisierte Chemikalie.

Oder ein kürzlich konstruiertes Plasmid.

„Management“ ist ähnlich zweideutig: Es kann sich darauf beziehen, um welche Art von Bioprobe oder Chemikalie es sich bei einer Probe handelt, wo sie aufbewahrt wird, wer sie zuletzt verwendet hat und wann oder wie viel davon aufbewahrt wird. Um all diese Probeninformationen zusammen mit der Probe selbst verwalten zu können, müssen Labore sorgfältig planen und auf diese Details achten.

Zum Glück gibt es dafür Softwarelösungen. Traditionell verwendeten Wissenschaftler Laboratory Inventory Management Systems (LIMS) für ein effizientes und effektives Probenmanagement, aber in jüngerer Zeit verlassen sich Wissenschaftler auf Plattformen der Digital Sample Management Software (DSM).

Es gibt einige subtile Unterschiede zwischen einem LIMS, einer DSM-Plattform und vielen anderen, aber unabhängig davon, wie Sie es nennen (wir werden LIMS im folgenden Blog verwenden), gibt es wichtige Funktionen zur Probenverwaltung, die alle Labore benötigen, um erfolgreich zu sein.

In diesem Blog habe ich 5 wichtige Merkmale für jede digitale Probenverwaltungsplattform hervorgehoben.

Rückverfolgbarkeit der Proben

Die Probenverfolgung ist unerlässlich, um die genaue Position einer Probe im Labor und ihren Aufbewahrungsort zu ermitteln. Dies ist besonders wichtig, wenn mehrere Forscher und Techniker auf dieselben Proben angewiesen sind oder diese regelmäßig verwenden.

Audit-Trail

Ein Audit-Trail bietet eine chronologische Aufzeichnung aller Aktivitäten zur Probenentnahme, Handhabung, Lagerung, Analyse und Entsorgung. Stellen Sie sich das als einen historischen Bericht darüber vor, wer, was, wann (bis auf Datum und Uhrzeit), wo, warum und wie eine Probe ist.

Audit-Trails sind unerlässlich, um die Integrität und Rückverfolgbarkeit einer Probe sicherzustellen. Es kann verwendet werden, um Abweichungen von den Standardarbeitsanweisungen oder potenzielle Fehler bei der Probenhandhabung zu identifizieren und alle an der Probe oder den zugehörigen Daten vorgenommenen Änderungen aufzuzeichnen.

Beispielaktualisierungen

So wie wir unseren Status in den sozialen Medien aktualisieren, erhalten Muster Status-Updates. Ein Beispiel wäre, wenn Sie etwas mit der Probe machen (z. B. auf Kontamination prüfen und die Probe nun auf „Kontamination: bestanden“ aktualisieren müssen). Da es sich um eine so häufig ausgeführte Aktivität handelt, muss jedes LIMS dafür schnelle und einfache Funktionen unterstützen.

Biologie- oder chemiespezifische Fähigkeiten

Es gibt LIMS, bei denen es sich um einfache oder listenbasierte Datenverwaltungsplattformen handelt. Aber was passiert, wenn Sie spezielle Daten speichern müssen, wie etwa Zeichenketten für die chemische Notation SMILES (Simplified Molecular-Input Line-Entry System), oder die Integration mit anderen digitalen Plattformen, wie z. B. das Rendern eines Plasmids von GenBank?

Viele Labore machen den Fehler, 4 oder 5 Softwareplattformen zu kaufen, um diese Anforderungen zu erfüllen, ohne zu wissen, dass es umfassende Lösungen gibt, die eine Vielzahl von notwendigen Probenverwaltungsaufgaben miteinander kombinieren.

Schau dir unseren Artikel an, „Das digitale Labor: Auf der Suche nach schlankeren, umweltfreundlicheren Abläufen“ in Natur was mehr darüber spricht.

Beispiel für eine Abstammung

Ganz gleich, ob Sie chemische Derivate oder die Eltern-Kind-Beziehung Ihrer Bioproben verfolgen möchten, stellen Sie sicher, dass Ihr System die Probenherkunft und die Beziehungen zwischen den Proben in Ihrer Sammlung verfolgen kann. Diese Funktion ist besonders wichtig, wenn Sie an folgenden Themen beteiligt sind Biobanking. Funktionen wie diese können manchmal übersehen werden oder als Teil von LIMS angesehen werden.

Finden Sie den besten Weg, Ihre Proben zu verwalten

Die besten Softwareplattformen verfügen über alle in das System eingebetteten Funktionen. Wenn eine Softwareplattform nicht in der Lage ist, diese Funktionen in einer einfach zu bedienenden, anpassbaren Oberfläche zu kombinieren, oder wenn Ihnen mehr Arbeit abfällt, ist sie möglicherweise nicht die effizienteste oder effektivste Lösung für Ihr Probenmanagement.

Lassen Sie uns über digitale Transformation, KI und die Welt der Biotechnologie chatten! Kontaktiere uns hier.

In biologischen und chemischen Forschungs- und Entwicklungslabors kann der Begriff „Probenmanagement“ viele verschiedene Bedeutungen haben.

Eine „Probe“ könnte eine lebende Maus in einer großen Kolonie sein.

Oder eine Zelllinie in einer Kryoröhre, die sich in ihrer 20. Passage befindet.

Oder eine neu synthetisierte Chemikalie.

Oder ein kürzlich konstruiertes Plasmid.

„Management“ ist ähnlich zweideutig: Es kann sich darauf beziehen, um welche Art von Bioprobe oder Chemikalie es sich bei einer Probe handelt, wo sie aufbewahrt wird, wer sie zuletzt verwendet hat und wann oder wie viel davon aufbewahrt wird. Um all diese Probeninformationen zusammen mit der Probe selbst verwalten zu können, müssen Labore sorgfältig planen und auf diese Details achten.

Zum Glück gibt es dafür Softwarelösungen. Traditionell verwendeten Wissenschaftler Laboratory Inventory Management Systems (LIMS) für ein effizientes und effektives Probenmanagement, aber in jüngerer Zeit verlassen sich Wissenschaftler auf Plattformen der Digital Sample Management Software (DSM).

Es gibt einige subtile Unterschiede zwischen einem LIMS, einer DSM-Plattform und vielen anderen, aber unabhängig davon, wie Sie es nennen (wir werden LIMS im folgenden Blog verwenden), gibt es wichtige Funktionen zur Probenverwaltung, die alle Labore benötigen, um erfolgreich zu sein.

In diesem Blog habe ich 5 wichtige Merkmale für jede digitale Probenverwaltungsplattform hervorgehoben.

Rückverfolgbarkeit der Proben

Die Probenverfolgung ist unerlässlich, um die genaue Position einer Probe im Labor und ihren Aufbewahrungsort zu ermitteln. Dies ist besonders wichtig, wenn mehrere Forscher und Techniker auf dieselben Proben angewiesen sind oder diese regelmäßig verwenden.

Audit-Trail

Ein Audit-Trail bietet eine chronologische Aufzeichnung aller Aktivitäten zur Probenentnahme, Handhabung, Lagerung, Analyse und Entsorgung. Stellen Sie sich das als einen historischen Bericht darüber vor, wer, was, wann (bis auf Datum und Uhrzeit), wo, warum und wie eine Probe ist.

Audit-Trails sind unerlässlich, um die Integrität und Rückverfolgbarkeit einer Probe sicherzustellen. Es kann verwendet werden, um Abweichungen von den Standardarbeitsanweisungen oder potenzielle Fehler bei der Probenhandhabung zu identifizieren und alle an der Probe oder den zugehörigen Daten vorgenommenen Änderungen aufzuzeichnen.

Beispielaktualisierungen

So wie wir unseren Status in den sozialen Medien aktualisieren, erhalten Muster Status-Updates. Ein Beispiel wäre, wenn Sie etwas mit der Probe machen (z. B. auf Kontamination prüfen und die Probe nun auf „Kontamination: bestanden“ aktualisieren müssen). Da es sich um eine so häufig ausgeführte Aktivität handelt, muss jedes LIMS dafür schnelle und einfache Funktionen unterstützen.

Biologie- oder chemiespezifische Fähigkeiten

Es gibt LIMS, bei denen es sich um einfache oder listenbasierte Datenverwaltungsplattformen handelt. Aber was passiert, wenn Sie spezielle Daten speichern müssen, wie etwa Zeichenketten für die chemische Notation SMILES (Simplified Molecular-Input Line-Entry System), oder die Integration mit anderen digitalen Plattformen, wie z. B. das Rendern eines Plasmids von GenBank?

Viele Labore machen den Fehler, 4 oder 5 Softwareplattformen zu kaufen, um diese Anforderungen zu erfüllen, ohne zu wissen, dass es umfassende Lösungen gibt, die eine Vielzahl von notwendigen Probenverwaltungsaufgaben miteinander kombinieren.

Schau dir unseren Artikel an, „Das digitale Labor: Auf der Suche nach schlankeren, umweltfreundlicheren Abläufen“ in Natur was mehr darüber spricht.

Beispiel für eine Abstammung

Ganz gleich, ob Sie chemische Derivate oder die Eltern-Kind-Beziehung Ihrer Bioproben verfolgen möchten, stellen Sie sicher, dass Ihr System die Probenherkunft und die Beziehungen zwischen den Proben in Ihrer Sammlung verfolgen kann. Diese Funktion ist besonders wichtig, wenn Sie an folgenden Themen beteiligt sind Biobanking. Funktionen wie diese können manchmal übersehen werden oder als Teil von LIMS angesehen werden.

Finden Sie den besten Weg, Ihre Proben zu verwalten

Die besten Softwareplattformen verfügen über alle in das System eingebetteten Funktionen. Wenn eine Softwareplattform nicht in der Lage ist, diese Funktionen in einer einfach zu bedienenden, anpassbaren Oberfläche zu kombinieren, oder wenn Ihnen mehr Arbeit abfällt, ist sie möglicherweise nicht die effizienteste oder effektivste Lösung für Ihr Probenmanagement.

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