Ce qu'il faut rechercher dans une plateforme de gestion des échantillons

Dans les laboratoires de R&D en biologie et en chimie, le terme « gestion des échantillons » peut avoir de nombreuses significations différentes.

Un « échantillon » pourrait être une souris vivante au sein d'une grande colonie.

Ou une lignée cellulaire dans un cryotube qui en est à son 20e passage.

Ou un produit chimique récemment synthétisé.

Ou un plasmide récemment construit.

La « gestion » est tout aussi ambiguë : elle peut faire référence au type d'échantillon biologique ou de produit chimique d'un échantillon, à l'endroit où il est stocké, à qui l'a utilisé en dernier, à quel moment ou à quelle quantité. Pour gérer toutes ces informations ainsi que l'échantillon lui-même, les laboratoires doivent planifier avec soin et prêter attention à ces détails.

Heureusement, il existe des solutions logicielles pour cela. Traditionnellement, les scientifiques utilisaient les systèmes de gestion des stocks de laboratoire (LIMS) pour gérer les échantillons de manière efficiente et efficace, mais plus récemment, les scientifiques se sont appuyés sur des plateformes logicielles de gestion numérique des échantillons (DSM).

Il existe quelques différences subtiles entre une plate-forme LIMS, une plate-forme DSM et bien d'autres, mais quel que soit le nom que vous lui donnez (nous utiliserons LIMS dans le blog suivant), tous les laboratoires ont besoin de fonctionnalités clés de gestion des échantillons pour réussir.

Dans ce blog, j'ai mis en évidence 5 caractéristiques essentielles de toute plateforme de gestion d'échantillons numériques.

Traçabilité des échantillons

Le suivi des échantillons est essentiel pour localiser l'emplacement exact d'un échantillon dans le laboratoire et l'endroit où il est stocké. Cela est particulièrement important lorsque plusieurs chercheurs et techniciens s'appuient sur les mêmes échantillons ou les utilisent régulièrement.

Piste d'audit

Une piste d'audit fournit un enregistrement chronologique de toutes les activités de collecte, de manipulation, de stockage, d'analyse et d'élimination des échantillons. Considérez-le comme un compte rendu historique indiquant qui, quoi, quand (en fonction de la date et de l'heure), où, pourquoi et comment d'un échantillon.

Les pistes d'audit sont essentielles pour garantir l'intégrité et la traçabilité d'un échantillon. Il peut être utilisé pour identifier tout écart par rapport aux procédures opérationnelles standard ou les erreurs potentielles dans la manipulation des échantillons et fournir un enregistrement de toute modification apportée à l'échantillon ou à ses données associées.

Exemples de mises à jour

Au fur et à mesure que nous mettons à jour notre statut sur les réseaux sociaux, les échantillons reçoivent des mises à jour de statut. Par exemple, lorsque vous faites quelque chose sur l'échantillon (par exemple, si vous vérifiez qu'il n'y a pas de contamination et que vous devez maintenant mettre à jour l'échantillon en « contamination : réussite »). Comme il s'agit d'une activité très fréquente, tout LIMS doit prendre en charge des fonctionnalités rapides et simples pour ce faire.

Capacités spécifiques à la biologie ou à la chimie

Il existe des LIMS qui sont des plateformes de gestion de données simples ou basées sur des listes. Mais que se passe-t-il si vous devez stocker des données spécialisées, telles que des chaînes de notation chimique du système simplifié d'entrée de lignes d'entrée moléculaire (SMILES) ou les intégrer à d'autres plateformes numériques, telles que le rendu d'un plasmide à partir de GenBank ?

De nombreux laboratoires font l'erreur d'acheter 4 ou 5 plateformes logicielles pour répondre à ces besoins sans se rendre compte qu'il existe des solutions complètes qui combinent diverses tâches de gestion des échantillons nécessaires.

Consultez notre article, « Le laboratoire numérique : à la recherche d'opérations plus simples et plus écologiques » dans La nature qui en dit plus à ce sujet.

Exemple de lignée

Qu'il s'agisse de suivre les dérivés chimiques ou la relation parent-enfant de vos échantillons biologiques, assurez-vous que votre système peut suivre les lignées des échantillons et les relations entre les échantillons de votre collection. Cette fonctionnalité devient particulièrement importante si vous participez à biobanques. De telles fonctionnalités peuvent parfois être négligées ou considérées comme faisant partie du LIMS.

Trouvez la meilleure façon de gérer vos échantillons

Les meilleures plateformes logicielles intègrent toutes les fonctionnalités au système. Si une plate-forme logicielle n'est pas capable de combiner ces fonctionnalités dans une interface facile à utiliser et personnalisable ou si elle vous demande plus de travail, il se peut que ce ne soit pas la solution la plus efficace pour la gestion de vos échantillons.

Parlons de la transformation numérique, de l'IA et du monde de la biotechnologie ! Contactez-nous ici.