5 défis opérationnels pour les biobanques

L'industrie des biobanques est devenue un pilier essentiel pour l'avancement des sciences de la vie et de la recherche clinique. Les biobanques sont des lieux sûrs pour des collections massives d'échantillons biologiques, qu'il s'agisse de biopsies de patients atteints de cancer ou d'échantillons environnementaux, ce qui en fait un élément essentiel des projets de recherche en cours dans les universités et l'industrie.

Au départ, le travail des biobanques était simple : collecter et gérer des échantillons et les distribuer de manière fiable aux clients. Toutefois, « Biobanques 3.0 » a réorienté son attention de la quantité vers l'assurance de la qualité des échantillons et des données, générant ainsi de la valeur pour les donateurs, les bailleurs de fonds et les scientifiques. Par conséquent, les biobanques actuelles et nouvelles sont tenues de relever le niveau de leurs capacités à créer des échantillons biologiques de la plus haute qualité et à offrir à leurs clients la meilleure expérience possible.

Cela crée de nouveaux défis en matière de gestion des échantillons et des données pour de nombreuses organisations de biobanques. Dans le blog suivant, nous examinons ces défis et la manière dont ils peuvent être résolus grâce à la numérisation.

Défi #1 : Gérer la quantité

Dans un enquête sur les biobanques basées aux États-Unis, près de 50 % des organisations possédaient plus de 5 000 échantillons et 23 % en avaient plus de 100 000. Le suivi de l'emplacement de ces grandes collections d'échantillons est un problème majeur, et il est essentiel de disposer de processus fiables pour étiqueter ou coder ces échantillons et documenter leur position de stockage pour maintenir l'organisation des opérations.

De plus, de nombreuses biobanques contiennent une variété d'échantillons biologiques comprenant divers types et sous-types de cellules. La manipulation d'un type de cellule primaire peut entraîner le stockage ultérieur de passages, de cellules immortalisées ou de variants cellulaires modifiés, avec de l'ADN, de l'ARN ou des protéines extraits à différents moments de ce processus. Chaque type de spécimen implique une documentation, des noms, des identifiants ou des propriétés distincts qui doivent être systématiquement liés au biospécimen. La variabilité entre les types d'échantillons pose un défi lorsqu'il s'agit d'identifier les propriétés spécifiques requises pour chaque échantillon. Dans le cas des échantillons humains, il est impératif de conserver les dossiers de consentement éclairé et les informations relatives à l'utilisation prévue à côté des échantillons afin de garantir le respect des normes éthiques et réglementaires.

Enfin, il a été suggéré que 10 % et 50 % des échantillons biologiques de tumeurs conservés dans les biobanques ne seront jamais utilisés. La collecte continue d'échantillons biologiques dans des biobanques déjà importantes peut entraîner des coûts d'investissement supplémentaires pour le stockage et compliquer la gestion de collections importantes et indisciplinées. Le suivi efficace des échantillons fréquemment et rarement utilisés est essentiel pour prendre des décisions concernant les nouveaux achats de chambres froides, l'utilisation efficace de l'espace et durabilité du laboratoire.

Défi #2 : Préserver l'intégrité et la qualité des échantillons

Les activités continues des grandes biobanques impliquent un afflux continu de nouveaux échantillons déposés et la réponse aux demandes d'échantillons. La qualité et l'intégrité de nombreux échantillons biologiques dépendent fortement de la température de stockage. Par conséquent, la répétition de cycles de gel-dégel, résultant d'une gestion désorganisée des échantillons, qui prend du temps à localiser et à vérifier les échantillons, peut compromettre leur intégrité. Lorsqu'une biobanque possède des aliquotes limitées d'un échantillon spécifique, les cycles de gel-dégel peuvent devenir un aspect inévitable du cycle de vie de l'échantillon. La gestion efficace des données de localisation de tous les échantillons biologiques, la supervision des températures des congélateurs et le suivi méticuleux des cycles de gel-dégel des échantillons sont des tâches cruciales, quoique des défis importants, essentielles pour garantir la qualité des échantillons.

L'accent étant mis de plus en plus sur la reproductibilité dans les sciences de la vie, il est également de plus en plus nécessaire de communiquer des informations standardisées pour les échantillons biologiques utilisés dans les articles publiés. Ces informations peuvent contribuer à garantir que des échantillons de haute qualité sont utilisés dans les études publiées, ce qui contribue à garantir la reproductibilité de toute étude ultérieure. Bien qu'il n'existe aucun ensemble de données pertinent convenu, des directives telles que le Déclaration des échantillons biologiques pour améliorer la qualité des études (BRISQ) ont été publiés pour améliorer la reproductibilité des articles utilisant des échantillons biologiques provenant de diverses sources, y compris des biobanques.

Défi #3 : Garantir la sécurité des données

De nombreux mandats et directives réglementaires façonnent de manière complexe le paysage opérationnel des biobanques. Plus précisément, 21 CFR, partie 11 décrit des réglementations précises régissant la gestion électronique des données afin de garantir la sécurité des données. En outre, des réglementations importantes telles que la Loi sur la portabilité et la responsabilité en matière d'assurance maladie (HIPAA), NORME ISO 20387 : 2018, et d'autres définissent des normes visant à maintenir la sécurité et la qualité des données.

Naviguer efficacement tout au long du cycle de vie de ces données présente des défis logistiques. Le respect des normes réglementaires susmentionnées nécessite la mise en œuvre cybersécurité des mesures visant à protéger les données contre tout accès non autorisé, à garantir une traçabilité complète à des fins d'auditabilité et à documenter méticuleusement toute modification apportée aux données.

Défi #4 : Préparation aux catastrophes

La préparation aux catastrophes représente un formidable défi pour les biobanques en raison de la vulnérabilité inhérente des échantillons biologiques qu'elles gèrent. Les activités quotidiennes des biobanques impliquent le stockage et la conservation méticuleux d'un large éventail d'échantillons biologiques, chacun ayant des exigences de température et d'environnement distinctes. Naturel, humain, ou des catastrophes technologiques peuvent perturber les conditions de stockage contrôlées, compromettant ainsi l'intégrité et la viabilité de ces précieux échantillons.

Pour garantir la continuité des opérations face à des événements imprévus, il est nécessaire de planifier de manière exhaustive la préparation aux catastrophes sur la base d'une évaluation adéquate des risques. Cela inclut le développement d'une infrastructure résiliente, la mise en œuvre de systèmes redondants et la formulation de plans d'urgence robustes pour atténuer les risques et minimiser les pertes potentielles. En outre, la coordination des efforts visant à déplacer et à sécuriser les échantillons en toute sécurité en cas d'urgence nécessite une exécution logistique précise, ce qui complique encore la préparation aux catastrophes dans les biobanques.

Défi #5 : Planifier l'avenir

Il y a eu une augmentation notable de la priorisation de la planification stratégique pour faire face à la croissance et à l'expansion des secteurs public et privé des biobanques. La planification future peut permettre aux biobanques de prendre des décisions judicieuses et éclairées concernant leurs initiatives futures, y compris des investissements ciblés dans des biens d'équipement tels que de nouveaux congélateurs -20 ou -80 ou le stockage d'azote liquide, à un moment précis pour répondre aux besoins réels. Le défi persistant pour les biobanques demeure la surveillance adéquate des opérations en cours et la projection de la demande future. Par conséquent, la collecte et l'analyse des données pour prendre une décision d'achat éclairée et stratégique prennent beaucoup de temps, en particulier lorsqu'elles sont effectuées manuellement.

Relever les défis des biobanques grâce à de meilleures plateformes de stockage d'informations

La plupart des défis ci-dessus peuvent être résolus grâce à des plateformes logicielles conviviales dotées de fonctionnalités de gestion des échantillons et des données, ce qui réduit le besoin de suivi manuel des échantillons ou de collecte et d'analyse des données.

Cependant, le choix de la plateforme logicielle adaptée à vos opérations de biobanques peut être une tâche difficile en soi. Pour vous aider à relever les défis évoqués ci-dessus (et d'autres) et à vous concentrer sur le logiciel le mieux adapté à votre organisation, lisez notre livre blanc, « Comment choisir la meilleure plateforme numérique pour votre biobanque. »