CloneAssist - BETA

CloneAssist wurde entwickelt, um Molekularbiologen dabei zu unterstützen, ihre Workflow-Funktionen mit Sequenzanalysen, Anmerkungen, Tracking und Berichten zu erweitern.

eLabNext sucht Benutzer, die daran interessiert sind, Betatester dieses Add-ons zu werden, um Feedback für Funktionsverbesserungen zu sammeln. Als Betatester erhalten Benutzer eine erweiterte einjährige kostenlose Testversion von CloneAssist. Bei der Vollversion wird CloneAssist als kostenpflichtiges Add-on angeboten.

Die wichtigsten Funktionen von CloneAssist — Überblick

1). Nahtlos in eLabNext integriert

• Die Datei wird in einem CloneAssist-Abschnitt gespeichert und eine Vorschau von CloneAssist wird angezeigt, während der Benutzer nicht daran arbeitet.
• Benutzer können jetzt in einem Experiment einen CloneAssist-Abschnitt erstellen.

2). Plasmid-Visualisierung

• Die Datendatei wird jetzt als Plasmid visualisiert. Hier werden alle Merkmale, Primer, offenen Leserahmen und Restriktionsenzyme angezeigt, sodass Sie die für Ihre Forschung relevantesten Teile leicht visualisieren können.

3). Gelelektrophorese

• Durch das Schneiden Ihrer Sequenz mit Restriktionsenzymen erhalten Benutzer verschiedene Fragmente, die häufig durch Gelelektrophorese verifiziert werden.
• CloneAssist bietet eine Visualisierung der Gelelektrophorese mit verschiedenen Markern.
• Das Gel kann eine oder mehrere Mehrfachreaktionen in einer Ansicht zeigen.

4). Schneiden Sie einfach Moleküle mit bestimmten Restriktionsenzymen ab und wenden Sie die Ergebnisse dann auf neue Moleküle an

• Wenn Sie Ihrem Röhrchen ein oder mehrere Restriktionsenzyme hinzufügen, können Benutzer direkt sehen, wie viele Schnitte das Restriktionsenzym in den Molekülen macht.
• Die Ergebnisse zeigen alle Fragmente, die bei der Schneidreaktion entstanden sind.

5). Visualisieren Sie sowohl die linearen als auch die kreisförmigen Sequenzen

• Wenn Sie eine Auswahl treffen oder ein interessantes Feature auswählen, werden die Ansichten synchronisiert.

6). Fügen Sie benutzerdefinierte Funktionen hinzu

• Fügen Sie der Sequenz Ihre benutzerdefinierten Funktionen hinzu, indem Sie den Mauszeiger über das Ende Ihrer Auswahl bewegen und auf „+ Funktion“ klicken.

7). Arbeite an mehreren Reaktionen gleichzeitig

• Es können mehrere Röhrchen erzeugt werden, um eine Reaktion durchzuführen. Sie können gleichzeitig geöffnet oder zur späteren Verwendung zusammengeklappt werden.

8). Mehrere Import-/Exportoptionen

• Wenn Sie einen neuen CloneAssist-Abschnitt starten, können Sie Daten aus verschiedenen Formaten wie Snapgene (.dna), GenBank (.gb), CloneManager (.cm5) und fasta (.fasta) importieren.
• Moleküle können als Bild (.png) exportiert werden.

9). Filtern Sie die Elemente nach den Bedürfnissen Ihres Labors

• Visualisierungen werden so erstellt, dass sie den Bedürfnissen der Benutzer entsprechen. Beispiel: Wenn der Benutzer nur an den Restriktionsenzymen interessiert ist, die das Molekül zerschneiden können, kann er alle anderen Visualisierungsoptionen deaktivieren.
• Es ist auch möglich, nur bestimmte Funktionen ein-/auszublenden.

10). Die Sequenzvisualisierung zeigt sehr detailliert, wie der DNA/RNA-Strang aufgebaut ist

• Linear View bietet detailliertere Informationen, z. B. die tatsächliche Sequenz.
• Wenn Benutzer mit der Maus über ein Enzym fahren, können sie die Schnittstellen sehen.