5 Défis opérationnels pour les biobanques

Le secteur des biobanques est devenu un pilier essentiel pour l'avancement des sciences de la vie et de la recherche clinique. Les biobanques sont des refuges pour des collections massives de spécimens biologiques, allant des biopsies de patients cancéreux aux échantillons environnementaux, ce qui en fait un élément essentiel des projets de recherche en cours dans les universités et l'industrie.

À l'origine, le travail des biobanques était simple : Collecter et gérer des échantillons et les distribuer de manière fiable aux clients. Mais.., "Biobanques 3.0 a fait passer l'accent de la quantité à l'assurance de la qualité des échantillons et des données, générant ainsi de la valeur pour les donateurs, les bailleurs de fonds et les scientifiques. Par conséquent, les biobanques actuelles et nouvelles sont tenues de relever le niveau de leurs capacités à créer des échantillons biologiques de la plus haute qualité et à offrir à leurs clients la meilleure expérience possible.

Cela crée de nouveaux défis en matière de gestion des échantillons et des données pour de nombreuses organisations de biobanques. Dans le blog suivant, nous examinons ces défis et la manière dont ils peuvent être résolus grâce à la numérisation.

Défi #1 : Gérer la quantité 

Dans un enquête sur les biobanques basées aux États-UnisPrès de 50% des organisations avaient plus de 5 000 échantillons, et 23% en avaient plus de 100 000. Le suivi de l'emplacement de ces grandes collections d'échantillons est un problème majeur, et il est essentiel de disposer de processus fiables pour l'étiquetage ou l'apposition de codes-barres sur ces échantillons et la documentation de leur position de stockage afin d'assurer l'organisation des opérations. 

En outre, de nombreuses biobanques hébergent une variété de spécimens biologiques englobant divers types et sous-types de cellules. La manipulation d'un type de cellule primaire peut entraîner le stockage ultérieur de passages, de cellules immortalisées ou de variantes de cellules modifiées, l'ADN, l'ARN ou les protéines étant extraits à différents moments de ce processus. Chaque type d'échantillon implique une documentation, des noms, des identifiants ou des propriétés distincts qui doivent être liés de manière cohérente à l'échantillon biologique. La variabilité entre les types d'échantillons pose un défi en ce qui concerne l'identification des propriétés spécifiques requises pour chaque échantillon. Dans le cas des échantillons humains, il est impératif de conserver les dossiers de consentement éclairé et les informations relatives à l'utilisation prévue avec les échantillons afin de garantir le respect des normes éthiques et réglementaires. 

Enfin, il a été suggéré que 10% et 50% de biospécimens de tumeurs dans les biobanques ne seront jamais utilisés. La poursuite de la collecte d'échantillons biologiques dans des biobanques déjà importantes peut entraîner des coûts d'investissement supplémentaires pour le stockage et des complications dans la gestion de collections importantes et indisciplinées. Un suivi efficace des échantillons fréquemment et rarement utilisés est essentiel pour prendre des décisions concernant l'achat de nouveaux entrepôts frigorifiques, l'utilisation efficace de l'espace et la gestion des collections. durabilité des laboratoires.

Défi #2 : Maintenir l'intégrité et la qualité des échantillons

Les activités courantes des grandes biobanques impliquent un afflux continu de nouveaux échantillons déposés et la satisfaction des demandes d'échantillons. La qualité et l'intégrité de nombreux échantillons biologiques dépendent fortement de la température de stockage. Par conséquent, l'apparition répétée de cycles de congélation-décongélation, résultant d'une gestion désorganisée des échantillons où l'on perd du temps à localiser et à vérifier les échantillons, peut compromettre leur intégrité. Lorsqu'une biobanque possède des aliquotes limitées d'un échantillon spécifique, les cycles de congélation-décongélation peuvent devenir un aspect inévitable du cycle de vie de l'échantillon. La gestion efficace des données de localisation de tous les échantillons biologiques, la surveillance des températures de congélation et le suivi méticuleux des cycles de congélation-décongélation des échantillons sont des tâches cruciales - mais aussi des défis importants - essentielles pour garantir la qualité des échantillons.

L'accent étant mis de plus en plus sur la reproductibilité dans les sciences de la vie, il est de plus en plus nécessaire de fournir des informations standardisées sur les échantillons biologiques utilisés dans les articles publiés. Ces informations permettent de s'assurer que des échantillons de haute qualité sont utilisés dans les études publiées, ce qui contribue à garantir la reproductibilité de toutes les études ultérieures. Bien qu'il n'existe pas d'ensemble de données pertinent convenu, des lignes directrices telles que le Rapport sur les échantillons biologiques pour l'amélioration de la qualité des études (BRISQ) ont été publiées pour améliorer la reproductibilité des articles utilisant des échantillons biologiques provenant de diverses sources, y compris des biobanques. 

Défi #3 : Assurer la sécurité des données

De nombreux mandats et lignes directrices réglementaires façonnent de manière complexe le paysage opérationnel des biobanques. En particulier, 21 CFR Part 11 décrit des réglementations précises régissant la gestion des données électroniques afin de garantir la sécurité des données. En outre, des réglementations importantes telles que le Loi sur la portabilité et la responsabilité en matière d'assurance maladie (HIPAA), ISO 20387:2018et d'autres établissent des normes pour maintenir la sécurité et la qualité des données. 

La gestion efficace de l'ensemble du cycle de vie de ces données présente des défis logistiques. Le respect des normes réglementaires susmentionnées nécessite la mise en œuvre de cybersécurité des mesures visant à protéger les données contre tout accès non autorisé, à assurer une traçabilité complète à des fins d'audit et à documenter méticuleusement toute modification apportée aux données.

Défi #4 : Préparation aux catastrophes

La préparation aux catastrophes représente un formidable défi pour les biobanques en raison de la vulnérabilité inhérente des échantillons biologiques qu'elles gèrent. Les opérations quotidiennes des biobanques impliquent le stockage et la conservation méticuleux d'une gamme variée d'échantillons biologiques, chacun ayant des exigences distinctes en matière de température et d'environnement. Naturelles, humainDes catastrophes naturelles ou technologiques peuvent perturber les conditions de stockage contrôlées, compromettant ainsi l'intégrité et la viabilité de ces précieux échantillons. 

Assurer la continuité des opérations face à des événements imprévus exige une planification complète de la préparation aux catastrophes basée sur une évaluation adéquate des risques. Il s'agit notamment de développer des infrastructures résistantes, de mettre en place des systèmes redondants et de formuler des plans d'urgence solides pour atténuer les risques et minimiser les pertes potentielles. En outre, la coordination des efforts pour déplacer et sécuriser les échantillons en toute sécurité pendant les situations d'urgence nécessite une exécution logistique précise, ce qui ajoute encore à la complexité de la préparation aux catastrophes dans le domaine des biobanques.

Défi #5 : Planifier l'avenir

Il y a eu une augmentation notable de la priorité accordée à la planification stratégique pour faire face à la croissance et à l'expansion des secteurs public et privé des biobanques. La planification future peut permettre aux biobanques de prendre des décisions astucieuses et bien informées concernant leurs initiatives futures, y compris des investissements ciblés dans des biens d'équipement tels que de nouveaux congélateurs -20 ou -80 ou le stockage d'azote liquide, précisément programmés pour répondre aux besoins réels. Le défi persistant pour les biobanques reste la surveillance adroite des opérations en cours et la projection des demandes futures. Par conséquent, la collecte et l'analyse des données pour prendre une décision d'achat éclairée et stratégique prennent beaucoup de temps, en particulier lorsqu'elles sont effectuées manuellement.

Relever les défis des biobanques grâce à de meilleures plates-formes de stockage de l'information

Bon nombre des problèmes susmentionnés peuvent être résolus grâce à des plateformes logicielles conviviales dotées de capacités de gestion des échantillons et des données, ce qui permet d'éviter le suivi manuel des échantillons ou la collecte et l'analyse des données. 

Cependant, le choix de la bonne plateforme logicielle pour vos opérations de biobanques peut être une tâche difficile en soi. Pour vous aider à relever les défis mentionnés ci-dessus (et d'autres) et à déterminer le logiciel le mieux adapté à votre organisation, lisez notre livre blanc, "Comment choisir la meilleure plateforme numérique pour votre biobanque".